91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3765 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  60.37 
 
 
766 aa  833    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  56.78 
 
 
756 aa  868    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  100 
 
 
749 aa  1486    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  42.5 
 
 
757 aa  645    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  58.34 
 
 
759 aa  866    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  57.31 
 
 
773 aa  861    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  58.34 
 
 
759 aa  866    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  36.96 
 
 
772 aa  428  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  36.96 
 
 
772 aa  428  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  35.5 
 
 
785 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  38.67 
 
 
793 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  36.09 
 
 
783 aa  422  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  36.09 
 
 
783 aa  422  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  35.28 
 
 
786 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  37.06 
 
 
778 aa  415  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  30.65 
 
 
777 aa  410  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  37.39 
 
 
781 aa  411  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  36.75 
 
 
773 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  34.9 
 
 
785 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  34.49 
 
 
802 aa  405  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  34.94 
 
 
773 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  36.78 
 
 
781 aa  385  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  36.18 
 
 
788 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  35.73 
 
 
773 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  35.6 
 
 
743 aa  360  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  37.44 
 
 
610 aa  261  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  32.74 
 
 
769 aa  234  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  35.56 
 
 
517 aa  191  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  35.6 
 
 
852 aa  189  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  38.44 
 
 
842 aa  184  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  34.01 
 
 
578 aa  178  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  42.86 
 
 
605 aa  177  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  36.12 
 
 
607 aa  173  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  38.01 
 
 
805 aa  171  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  38.01 
 
 
831 aa  171  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  34.98 
 
 
913 aa  163  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  33.79 
 
 
705 aa  161  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  32.84 
 
 
633 aa  159  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  35.84 
 
 
631 aa  158  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  36.39 
 
 
614 aa  156  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  37.2 
 
 
624 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  35.49 
 
 
637 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  29.57 
 
 
1006 aa  154  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  32.53 
 
 
633 aa  152  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  33.23 
 
 
636 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  32.23 
 
 
633 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.99 
 
 
618 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  34.36 
 
 
647 aa  147  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.26 
 
 
562 aa  147  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  35.62 
 
 
644 aa  146  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  36.51 
 
 
674 aa  144  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  35.29 
 
 
647 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  34.92 
 
 
677 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  38.44 
 
 
624 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  34.26 
 
 
637 aa  142  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  38.44 
 
 
624 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  34.27 
 
 
689 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  35.42 
 
 
638 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  34.27 
 
 
689 aa  140  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  33.56 
 
 
650 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  35.03 
 
 
612 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  37.13 
 
 
618 aa  129  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  32.29 
 
 
645 aa  126  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  35.66 
 
 
612 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  34.58 
 
 
570 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  35.23 
 
 
576 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  34.24 
 
 
570 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  34.24 
 
 
570 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  34.74 
 
 
612 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  36.7 
 
 
532 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  34.52 
 
 
570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  33.94 
 
 
564 aa  100  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  30.69 
 
 
510 aa  98.2  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  31.06 
 
 
510 aa  97.4  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  31.06 
 
 
510 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  31.06 
 
 
510 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
571 aa  89  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  28.6 
 
 
519 aa  87.4  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  32.97 
 
 
571 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  30.31 
 
 
510 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  32.97 
 
 
571 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  32.76 
 
 
552 aa  70.1  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  24.73 
 
 
582 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  23.51 
 
 
638 aa  49.3  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  24.43 
 
 
628 aa  48.9  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  24.43 
 
 
628 aa  48.9  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  24.54 
 
 
584 aa  48.5  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.89 
 
 
647 aa  48.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  23.46 
 
 
629 aa  47  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  28 
 
 
622 aa  46.2  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 
696 aa  45.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>