42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0933 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0442  von Willebrand factor, type A  54.69 
 
 		 646 aa  646    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3906  von Willebrand factor, type A  60.73 
 
 		 664 aa  728    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0145904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3115  von Willebrand factor type A  55.84 
 
 		 653 aa  664    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.905029  hitchhiker  0.0000163012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0822  von Willebrand factor type A  59.88 
 
 		 665 aa  718    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0933  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 661 aa  1309    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8560  hypothetical protein  57.58 
 
 		 648 aa  689    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1893  von Willebrand factor, type A  59.97 
 
 		 662 aa  741    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.376882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1053  von Willebrand factor type A  62.14 
 
 		 655 aa  724    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.463528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1094  von Willebrand factor type A  56.26 
 
 		 674 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.723925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0550  von Willebrand factor type A  52.92 
 
 		 647 aa  586  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1379  von Willebrand factor type A  50.61 
 
 		 667 aa  587  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2193  von Willebrand factor type A  50.99 
 
 		 648 aa  582  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4693  von Willebrand factor, type A  50 
 
 		 665 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.93356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4399  von Willebrand factor, type A  49.85 
 
 		 665 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4313  von Willebrand factor, type A  49.85 
 
 		 665 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.844585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1878  von Willebrand factor, type A  50.46 
 
 		 658 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0679777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10977  hypothetical protein  52.53 
 
 		 672 aa  560  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.765365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3298  von Willebrand factor type A  48.62 
 
 		 663 aa  555  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4853  von Willebrand factor, type A  49.17 
 
 		 668 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381001 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1770  von Willebrand factor type A  50.54 
 
 		 666 aa  532  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000116678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1987  von Willebrand factor, type A  49.01 
 
 		 667 aa  524  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0953  von Willebrand factor, type A  47.7 
 
 		 670 aa  505  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22290  uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  43.94 
 
 		 654 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.174866  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1871  von Willebrand factor type A (vWA) domain protein-like protein  33.53 
 
 		 680 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0310  von Willebrand factor type A  35.33 
 
 		 648 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3257  von Willebrand factor, type A  28.64 
 
 		 415 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.382216  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2602  von Willebrand factor type A  33.22 
 
 		 366 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0521  von Willebrand factor type A  30.91 
 
 		 382 aa  144  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0371  von Willebrand factor type A  30.49 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4670  putative uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain  27.92 
 
 		 366 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  hitchhiker  0.00000104665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4337  von Willebrand factor type A (vWA)domain-containing protein  29.07 
 
 		 372 aa  130  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0306  von Willebrand factor, type A  28.82 
 
 		 404 aa  129  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.813873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0340  hypothetical protein  26.83 
 
 		 367 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000105714  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5786  hypothetical protein  28.8 
 
 		 369 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08796  hypothetical protein  28.39 
 
 		 372 aa  120  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3740  hypothetical protein  26.14 
 
 		 338 aa  115  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2430  von Willebrand factor type A  26.61 
 
 		 406 aa  113  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1092  putative cytoplasmic protein  28.38 
 
 		 407 aa  110  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  28.99 
 
 		 650 aa  51.2  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  27.23 
 
 		 683 aa  48.5  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  25.28 
 
 		 643 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  30.39 
 
 		 696 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>