40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0442 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3906  von Willebrand factor, type A  56.62 
 
 
664 aa  649    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0145904  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0933  von Willebrand factor type A  54.78 
 
 
661 aa  646    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8560  hypothetical protein  61.09 
 
 
648 aa  710    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1053  von Willebrand factor type A  64.01 
 
 
655 aa  716    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.463528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0442  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
646 aa  1253    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0822  von Willebrand factor type A  56.15 
 
 
665 aa  643    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1893  von Willebrand factor, type A  60.09 
 
 
662 aa  712    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.376882  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3115  von Willebrand factor type A  59.15 
 
 
653 aa  684    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.905029  hitchhiker  0.0000163012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2193  von Willebrand factor type A  51.39 
 
 
648 aa  582  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4399  von Willebrand factor, type A  47.54 
 
 
665 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471327  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4693  von Willebrand factor, type A  47.69 
 
 
665 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.93356  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4313  von Willebrand factor, type A  47.54 
 
 
665 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.844585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3298  von Willebrand factor type A  49.22 
 
 
663 aa  555  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0550  von Willebrand factor type A  51.17 
 
 
647 aa  550  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1878  von Willebrand factor, type A  47.55 
 
 
658 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0679777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10977  hypothetical protein  49.69 
 
 
672 aa  534  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.765365  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1094  von Willebrand factor type A  51.16 
 
 
674 aa  531  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.723925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4853  von Willebrand factor, type A  46.28 
 
 
668 aa  527  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381001 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1379  von Willebrand factor type A  46.22 
 
 
667 aa  523  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0953  von Willebrand factor, type A  47.98 
 
 
670 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1770  von Willebrand factor type A  48.06 
 
 
666 aa  491  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000116678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1987  von Willebrand factor, type A  46.67 
 
 
667 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8816  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22290  uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  45.75 
 
 
654 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.174866  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1871  von Willebrand factor type A (vWA) domain protein-like protein  32.68 
 
 
680 aa  332  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0310  von Willebrand factor type A  33.69 
 
 
648 aa  211  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2602  von Willebrand factor type A  34.67 
 
 
366 aa  150  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0306  von Willebrand factor, type A  32.52 
 
 
404 aa  137  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.813873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3257  von Willebrand factor, type A  30.56 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.382216  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4670  putative uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain  29.14 
 
 
366 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  hitchhiker  0.00000104665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0521  von Willebrand factor type A  29.71 
 
 
382 aa  127  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3740  hypothetical protein  28.29 
 
 
338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5786  hypothetical protein  29.74 
 
 
369 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115638  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0340  hypothetical protein  28.2 
 
 
367 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000105714  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0371  von Willebrand factor type A  28.66 
 
 
365 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4337  von Willebrand factor type A (vWA)domain-containing protein  27.01 
 
 
372 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2430  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
406 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08796  hypothetical protein  27.36 
 
 
372 aa  97.8  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1092  putative cytoplasmic protein  27.56 
 
 
407 aa  97.1  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.56 
 
 
616 aa  44.3  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  26.6 
 
 
223 aa  44.3  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>