38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08796 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08796  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  778    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4337  von Willebrand factor type A (vWA)domain-containing protein  75.27 
 
 
372 aa  600  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4670  putative uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain  61.79 
 
 
366 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  hitchhiker  0.00000104665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5786  hypothetical protein  61.04 
 
 
369 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115638  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0371  von Willebrand factor type A  59.13 
 
 
365 aa  459  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0340  hypothetical protein  58.38 
 
 
367 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000105714  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3740  hypothetical protein  60.41 
 
 
338 aa  432  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2602  von Willebrand factor type A  52.72 
 
 
366 aa  391  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0306  von Willebrand factor, type A  36.07 
 
 
404 aa  236  7e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.813873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1092  putative cytoplasmic protein  37.74 
 
 
407 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2430  von Willebrand factor type A  39.05 
 
 
406 aa  229  7e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3257  von Willebrand factor, type A  37.43 
 
 
415 aa  225  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.382216  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1871  von Willebrand factor type A (vWA) domain protein-like protein  35.66 
 
 
680 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3115  von Willebrand factor type A  28.21 
 
 
653 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.905029  hitchhiker  0.0000163012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1893  von Willebrand factor, type A  29.94 
 
 
662 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.376882  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0521  von Willebrand factor type A  28.07 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0550  von Willebrand factor type A  30.23 
 
 
647 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1094  von Willebrand factor type A  27.59 
 
 
674 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.723925 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0310  von Willebrand factor type A  31.4 
 
 
648 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3298  von Willebrand factor type A  29.43 
 
 
663 aa  119  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1053  von Willebrand factor type A  28.39 
 
 
655 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.463528  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0933  von Willebrand factor type A  28.38 
 
 
661 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1770  von Willebrand factor type A  29.62 
 
 
666 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000116678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0822  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 
665 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1878  von Willebrand factor, type A  28.53 
 
 
658 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0679777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4693  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 
665 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.93356  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2193  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 
648 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4399  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 
665 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471327  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4313  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 
665 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.844585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3906  von Willebrand factor, type A  27.24 
 
 
664 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0145904  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8560  hypothetical protein  26.35 
 
 
648 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4853  von Willebrand factor, type A  26.88 
 
 
668 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22290  uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  27.38 
 
 
654 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.174866  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10977  hypothetical protein  29.17 
 
 
672 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.765365  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1987  von Willebrand factor, type A  29.03 
 
 
667 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1379  von Willebrand factor type A  27.57 
 
 
667 aa  103  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0953  von Willebrand factor, type A  28.1 
 
 
670 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0442  von Willebrand factor, type A  27.36 
 
 
646 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>