39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2602 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2602  von Willebrand factor type A  100 
 
 
366 aa  753    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0371  von Willebrand factor type A  57.64 
 
 
365 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0340  hypothetical protein  54.12 
 
 
367 aa  428  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000105714  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4670  putative uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain  53.15 
 
 
366 aa  428  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  hitchhiker  0.00000104665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5786  hypothetical protein  54.64 
 
 
369 aa  425  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115638  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3740  hypothetical protein  55.62 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4337  von Willebrand factor type A (vWA)domain-containing protein  55.37 
 
 
372 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08796  hypothetical protein  52.72 
 
 
372 aa  391  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3257  von Willebrand factor, type A  45.45 
 
 
415 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.382216  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0306  von Willebrand factor, type A  43.11 
 
 
404 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.813873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1871  von Willebrand factor type A (vWA) domain protein-like protein  41.35 
 
 
680 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2430  von Willebrand factor type A  39.66 
 
 
406 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1092  putative cytoplasmic protein  36.74 
 
 
407 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1094  von Willebrand factor type A  34.82 
 
 
674 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.723925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1053  von Willebrand factor type A  37.83 
 
 
655 aa  176  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.463528  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3115  von Willebrand factor type A  35.67 
 
 
653 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.905029  hitchhiker  0.0000163012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0521  von Willebrand factor type A  30.73 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1893  von Willebrand factor, type A  35.62 
 
 
662 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.376882  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3906  von Willebrand factor, type A  34.6 
 
 
664 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0145904  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0933  von Willebrand factor type A  32.67 
 
 
661 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0822  von Willebrand factor type A  35.02 
 
 
665 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8560  hypothetical protein  33 
 
 
648 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0442  von Willebrand factor, type A  34.67 
 
 
646 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4313  von Willebrand factor, type A  36.68 
 
 
665 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.844585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4693  von Willebrand factor, type A  36.68 
 
 
665 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.93356  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4399  von Willebrand factor, type A  36.68 
 
 
665 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471327  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4853  von Willebrand factor, type A  34.86 
 
 
668 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1878  von Willebrand factor, type A  35.31 
 
 
658 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0679777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0550  von Willebrand factor type A  34.75 
 
 
647 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10977  hypothetical protein  34.5 
 
 
672 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.765365  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0310  von Willebrand factor type A  36.75 
 
 
648 aa  137  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2193  von Willebrand factor type A  34.75 
 
 
648 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1770  von Willebrand factor type A  33.45 
 
 
666 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000116678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3298  von Willebrand factor type A  35.24 
 
 
663 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22290  uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  31.55 
 
 
654 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.174866  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1987  von Willebrand factor, type A  32.75 
 
 
667 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1379  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 
667 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0953  von Willebrand factor, type A  31.56 
 
 
670 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  30.05 
 
 
958 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>