38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0340 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0340  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  758    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000105714  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5786  hypothetical protein  78.32 
 
 		 369 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0371  von Willebrand factor type A  67.57 
 
 		 365 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4670  putative uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain  64.84 
 
 		 366 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  hitchhiker  0.00000104665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3740  hypothetical protein  66.67 
 
 		 338 aa  486  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08796  hypothetical protein  58.38 
 
 		 372 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4337  von Willebrand factor type A (vWA)domain-containing protein  59.19 
 
 		 372 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2602  von Willebrand factor type A  54.12 
 
 		 366 aa  428  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3257  von Willebrand factor, type A  38.59 
 
 		 415 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.382216  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0306  von Willebrand factor, type A  41.12 
 
 		 404 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.813873 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2430  von Willebrand factor type A  39.93 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1092  putative cytoplasmic protein  39.22 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1871  von Willebrand factor type A (vWA) domain protein-like protein  38.11 
 
 		 680 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1893  von Willebrand factor, type A  31.21 
 
 		 662 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.376882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4313  von Willebrand factor, type A  31.29 
 
 		 665 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.844585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4693  von Willebrand factor, type A  31.29 
 
 		 665 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.93356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4399  von Willebrand factor, type A  31.29 
 
 		 665 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0521  von Willebrand factor type A  29.88 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3906  von Willebrand factor, type A  29.87 
 
 		 664 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0145904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1878  von Willebrand factor, type A  30.55 
 
 		 658 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0679777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4853  von Willebrand factor, type A  29.56 
 
 		 668 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8560  hypothetical protein  29.21 
 
 		 648 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10977  hypothetical protein  30.07 
 
 		 672 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.765365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0550  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 		 647 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1053  von Willebrand factor type A  29.37 
 
 		 655 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.463528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0822  von Willebrand factor type A  30.23 
 
 		 665 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2193  von Willebrand factor type A  31.88 
 
 		 648 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3115  von Willebrand factor type A  29.77 
 
 		 653 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.905029  hitchhiker  0.0000163012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3298  von Willebrand factor type A  30.06 
 
 		 663 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1094  von Willebrand factor type A  29.44 
 
 		 674 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.723925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0933  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 661 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0442  von Willebrand factor, type A  28.2 
 
 		 646 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0310  von Willebrand factor type A  29.64 
 
 		 648 aa  116  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1379  von Willebrand factor type A  28.89 
 
 		 667 aa  113  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1770  von Willebrand factor type A  27.76 
 
 		 666 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000116678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1987  von Willebrand factor, type A  28.95 
 
 		 667 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8816  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22290  uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  27.24 
 
 		 654 aa  109  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.174866  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0953  von Willebrand factor, type A  26.73 
 
 		 670 aa  99.4  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>