45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1987 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10977  hypothetical protein  63.82 
 
 
672 aa  753    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.765365  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1379  von Willebrand factor type A  60.79 
 
 
667 aa  773    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0550  von Willebrand factor type A  56.36 
 
 
647 aa  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2193  von Willebrand factor type A  58.55 
 
 
648 aa  714    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1770  von Willebrand factor type A  85.71 
 
 
666 aa  1090    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000116678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1878  von Willebrand factor, type A  62.5 
 
 
658 aa  777    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0679777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4693  von Willebrand factor, type A  62.22 
 
 
665 aa  782    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.93356  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4853  von Willebrand factor, type A  62.09 
 
 
668 aa  775    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381001 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4399  von Willebrand factor, type A  62.06 
 
 
665 aa  781    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471327  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3298  von Willebrand factor type A  60 
 
 
663 aa  743    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1987  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
667 aa  1331    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0953  von Willebrand factor, type A  69.65 
 
 
670 aa  838    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4313  von Willebrand factor, type A  62.06 
 
 
665 aa  781    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.844585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22290  uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  50.15 
 
 
654 aa  565  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.174866  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1893  von Willebrand factor, type A  48.46 
 
 
662 aa  550  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.376882  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0933  von Willebrand factor type A  48.92 
 
 
661 aa  547  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0822  von Willebrand factor type A  49.32 
 
 
665 aa  531  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0442  von Willebrand factor, type A  46.67 
 
 
646 aa  514  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1094  von Willebrand factor type A  49.16 
 
 
674 aa  514  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.723925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1053  von Willebrand factor type A  48.4 
 
 
655 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.463528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3906  von Willebrand factor, type A  48.64 
 
 
664 aa  504  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0145904  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8560  hypothetical protein  46.53 
 
 
648 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3115  von Willebrand factor type A  45.74 
 
 
653 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.905029  hitchhiker  0.0000163012 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1871  von Willebrand factor type A (vWA) domain protein-like protein  32.38 
 
 
680 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0310  von Willebrand factor type A  32.82 
 
 
648 aa  243  7.999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0521  von Willebrand factor type A  30.82 
 
 
382 aa  140  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3257  von Willebrand factor, type A  29.8 
 
 
415 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.382216  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0306  von Willebrand factor, type A  29.47 
 
 
404 aa  126  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.813873 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2602  von Willebrand factor type A  32.75 
 
 
366 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0371  von Willebrand factor type A  27.57 
 
 
365 aa  113  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0340  hypothetical protein  28.95 
 
 
367 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000105714  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4670  putative uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain  27.04 
 
 
366 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  hitchhiker  0.00000104665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5786  hypothetical protein  29.38 
 
 
369 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115638  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08796  hypothetical protein  29.03 
 
 
372 aa  107  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2430  von Willebrand factor type A  25.78 
 
 
406 aa  100  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1092  putative cytoplasmic protein  27.14 
 
 
407 aa  96.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4337  von Willebrand factor type A (vWA)domain-containing protein  28.63 
 
 
372 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3740  hypothetical protein  26.57 
 
 
338 aa  95.5  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.97 
 
 
674 aa  49.3  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  33.82 
 
 
329 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.17 
 
 
673 aa  47.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  32.88 
 
 
696 aa  45.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.16 
 
 
653 aa  44.3  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  34.01 
 
 
719 aa  43.9  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0817  Magnesium chelatase  31.65 
 
 
607 aa  43.9  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>