42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1893 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3906  von Willebrand factor, type A  61.19 
 
 
664 aa  735    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0145904  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3115  von Willebrand factor type A  64.44 
 
 
653 aa  782    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.905029  hitchhiker  0.0000163012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0442  von Willebrand factor, type A  59.97 
 
 
646 aa  715    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1053  von Willebrand factor type A  71.1 
 
 
655 aa  841    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.463528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0822  von Willebrand factor type A  62.14 
 
 
665 aa  758    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1893  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
662 aa  1300    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.376882  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8560  hypothetical protein  65.75 
 
 
648 aa  804    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0933  von Willebrand factor type A  59.97 
 
 
661 aa  747    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2193  von Willebrand factor type A  50.23 
 
 
648 aa  600  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1094  von Willebrand factor type A  52.31 
 
 
674 aa  581  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.723925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0550  von Willebrand factor type A  50.46 
 
 
647 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4399  von Willebrand factor, type A  45.84 
 
 
665 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471327  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4313  von Willebrand factor, type A  45.84 
 
 
665 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.844585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4693  von Willebrand factor, type A  45.99 
 
 
665 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.93356  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10977  hypothetical protein  48.55 
 
 
672 aa  533  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.765365  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1770  von Willebrand factor type A  48.77 
 
 
666 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000116678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1878  von Willebrand factor, type A  46.21 
 
 
658 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0679777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1379  von Willebrand factor type A  45.57 
 
 
667 aa  530  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1987  von Willebrand factor, type A  48.55 
 
 
667 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8816  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4853  von Willebrand factor, type A  45.56 
 
 
668 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3298  von Willebrand factor type A  44.8 
 
 
663 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0953  von Willebrand factor, type A  46.94 
 
 
670 aa  490  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22290  uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  44.44 
 
 
654 aa  488  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.174866  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1871  von Willebrand factor type A (vWA) domain protein-like protein  35.63 
 
 
680 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0310  von Willebrand factor type A  33.38 
 
 
648 aa  230  8e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2602  von Willebrand factor type A  35.99 
 
 
366 aa  170  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3257  von Willebrand factor, type A  31.58 
 
 
415 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.382216  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5786  hypothetical protein  33.85 
 
 
369 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115638  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0340  hypothetical protein  31.66 
 
 
367 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000105714  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0521  von Willebrand factor type A  30.95 
 
 
382 aa  143  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0306  von Willebrand factor, type A  30.17 
 
 
404 aa  139  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.813873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4670  putative uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain  30.87 
 
 
366 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  hitchhiker  0.00000104665 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08796  hypothetical protein  30.03 
 
 
372 aa  134  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0371  von Willebrand factor type A  31.31 
 
 
365 aa  134  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3740  hypothetical protein  30.16 
 
 
338 aa  127  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4337  von Willebrand factor type A (vWA)domain-containing protein  29.01 
 
 
372 aa  123  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2430  von Willebrand factor type A  27.93 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1092  putative cytoplasmic protein  27.76 
 
 
407 aa  111  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  29.74 
 
 
329 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  31.37 
 
 
696 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  30.67 
 
 
653 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  26.74 
 
 
788 aa  45.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>