More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1020 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  100 
 
 		 653 aa  1301    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  68.09 
 
 		 650 aa  855    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  52.82 
 
 		 689 aa  631  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  47.74 
 
 		 660 aa  546  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.47 
 
 		 688 aa  538  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  48.6 
 
 		 670 aa  536  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  43.83 
 
 		 696 aa  461  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  41.39 
 
 		 669 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  39.1 
 
 		 680 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  39.23 
 
 		 614 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.44 
 
 		 622 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.59 
 
 		 665 aa  393  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.44 
 
 		 622 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.44 
 
 		 622 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  38.43 
 
 		 617 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  43.32 
 
 		 657 aa  382  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  38.95 
 
 		 612 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  37.41 
 
 		 637 aa  379  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  41.63 
 
 		 705 aa  379  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  40 
 
 		 674 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  41.04 
 
 		 626 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  41.31 
 
 		 719 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  41 
 
 		 638 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  40.63 
 
 		 629 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  41.3 
 
 		 680 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  42.38 
 
 		 674 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  42.2 
 
 		 618 aa  363  7.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.4 
 
 		 674 aa  349  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  39.64 
 
 		 699 aa  347  4e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  40.03 
 
 		 653 aa  343  8e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  39.86 
 
 		 738 aa  340  4e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  43.1 
 
 		 690 aa  340  5e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  34.25 
 
 		 619 aa  310  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  51.4 
 
 		 372 aa  304  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.33 
 
 		 677 aa  301  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  49.85 
 
 		 346 aa  298  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  29.97 
 
 		 643 aa  294  3e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.3 
 
 		 374 aa  292  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  51.55 
 
 		 364 aa  292  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.06 
 
 		 364 aa  289  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  49.09 
 
 		 347 aa  288  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.99 
 
 		 373 aa  287  5e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.96 
 
 		 616 aa  286  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.99 
 
 		 357 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  46.97 
 
 		 351 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  49.22 
 
 		 364 aa  284  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  47.26 
 
 		 345 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.68 
 
 		 362 aa  283  7.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.06 
 
 		 358 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.06 
 
 		 358 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.37 
 
 		 369 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  45.62 
 
 		 356 aa  281  3e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.58 
 
 		 405 aa  281  4e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.06 
 
 		 362 aa  280  7e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.13 
 
 		 362 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.13 
 
 		 362 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.13 
 
 		 362 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.13 
 
 		 362 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.13 
 
 		 362 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  47.94 
 
 		 365 aa  278  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.13 
 
 		 362 aa  276  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.75 
 
 		 362 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.31 
 
 		 383 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  47.63 
 
 		 342 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.56 
 
 		 382 aa  273  6e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.19 
 
 		 386 aa  273  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.56 
 
 		 384 aa  272  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  47.99 
 
 		 363 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.59 
 
 		 600 aa  270  5e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.62 
 
 		 391 aa  270  8e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  31.01 
 
 		 594 aa  269  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  47.06 
 
 		 309 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  33.28 
 
 		 725 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  46.65 
 
 		 337 aa  266  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.06 
 
 		 383 aa  265  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.77 
 
 		 337 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  46.47 
 
 		 344 aa  264  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.77 
 
 		 337 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  44.85 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.45 
 
 		 337 aa  261  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  45.29 
 
 		 333 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.22 
 
 		 337 aa  260  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.25 
 
 		 386 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.95 
 
 		 788 aa  260  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  49.12 
 
 		 337 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.91 
 
 		 335 aa  259  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  48.77 
 
 		 337 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.43 
 
 		 727 aa  258  3e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  46.15 
 
 		 334 aa  258  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  33.97 
 
 		 711 aa  258  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  48.42 
 
 		 340 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1178  magnesium chelatase, ChlI subunit  46.42 
 
 		 358 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1658  magnesium chelatase  46.42 
 
 		 358 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  44.65 
 
 		 443 aa  253  6e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3097  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.8 
 
 		 333 aa  253  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  43.59 
 
 		 346 aa  253  8.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.95 
 
 		 341 aa  253  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  47.3 
 
 		 334 aa  253  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.89 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  47.3 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>