42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2193 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1379  von Willebrand factor type A  58.55 
 
 		 667 aa  722    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10977  hypothetical protein  62.96 
 
 		 672 aa  746    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.765365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1878  von Willebrand factor, type A  62.17 
 
 		 658 aa  771    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0679777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4693  von Willebrand factor, type A  62.83 
 
 		 665 aa  792    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.93356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4853  von Willebrand factor, type A  61.67 
 
 		 668 aa  770    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381001 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4399  von Willebrand factor, type A  62.98 
 
 		 665 aa  791    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3298  von Willebrand factor type A  59.22 
 
 		 663 aa  726    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0953  von Willebrand factor, type A  59.6 
 
 		 670 aa  678    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1987  von Willebrand factor, type A  58.55 
 
 		 667 aa  678    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8816  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1770  von Willebrand factor type A  58.86 
 
 		 666 aa  684    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000116678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4313  von Willebrand factor, type A  62.98 
 
 		 665 aa  791    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.844585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2193  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 648 aa  1268    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22290  uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  58.4 
 
 		 654 aa  683    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.174866  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0550  von Willebrand factor type A  64.6 
 
 		 647 aa  791    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0822  von Willebrand factor type A  52.38 
 
 		 665 aa  594  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1893  von Willebrand factor, type A  49.92 
 
 		 662 aa  590  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.376882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0442  von Willebrand factor, type A  51.39 
 
 		 646 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0933  von Willebrand factor type A  50.84 
 
 		 661 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1094  von Willebrand factor type A  53.42 
 
 		 674 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.723925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8560  hypothetical protein  49.85 
 
 		 648 aa  569  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1053  von Willebrand factor type A  50.46 
 
 		 655 aa  567  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.463528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3906  von Willebrand factor, type A  50.99 
 
 		 664 aa  560  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0145904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3115  von Willebrand factor type A  48.18 
 
 		 653 aa  525  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.905029  hitchhiker  0.0000163012 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1871  von Willebrand factor type A (vWA) domain protein-like protein  31.59 
 
 		 680 aa  320  7e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0310  von Willebrand factor type A  31.82 
 
 		 648 aa  210  6e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2602  von Willebrand factor type A  34.75 
 
 		 366 aa  135  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0340  hypothetical protein  31.88 
 
 		 367 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000105714  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0371  von Willebrand factor type A  29.8 
 
 		 365 aa  127  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3257  von Willebrand factor, type A  29.79 
 
 		 415 aa  127  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.382216  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0521  von Willebrand factor type A  29.66 
 
 		 382 aa  126  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0306  von Willebrand factor, type A  30.07 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.813873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5786  hypothetical protein  32.04 
 
 		 369 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4670  putative uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain  29.37 
 
 		 366 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  hitchhiker  0.00000104665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4337  von Willebrand factor type A (vWA)domain-containing protein  28.62 
 
 		 372 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08796  hypothetical protein  29.63 
 
 		 372 aa  115  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3740  hypothetical protein  28.42 
 
 		 338 aa  114  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2430  von Willebrand factor type A  28.92 
 
 		 406 aa  109  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1092  putative cytoplasmic protein  27.87 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.5 
 
 		 653 aa  48.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  27.51 
 
 		 650 aa  47  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.76 
 
 		 673 aa  46.6  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  35.57 
 
 		 699 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>