More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1277 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  68.09 
 
 
653 aa  858    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  100 
 
 
650 aa  1311    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  54.41 
 
 
689 aa  670    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  47.14 
 
 
670 aa  548  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  46.67 
 
 
660 aa  535  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.9 
 
 
688 aa  521  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  40.67 
 
 
669 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  42.36 
 
 
696 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  38.98 
 
 
680 aa  442  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  39.94 
 
 
614 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  39.53 
 
 
617 aa  398  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.95 
 
 
622 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.95 
 
 
622 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.95 
 
 
622 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.07 
 
 
674 aa  385  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  42.01 
 
 
657 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  38.34 
 
 
637 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  41.5 
 
 
629 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  39.2 
 
 
612 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.63 
 
 
665 aa  372  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  38.46 
 
 
680 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  39.83 
 
 
705 aa  369  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  39.63 
 
 
626 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  39.42 
 
 
719 aa  360  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  40.29 
 
 
674 aa  360  4e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  40.96 
 
 
618 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  40.06 
 
 
638 aa  356  7.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.32 
 
 
653 aa  355  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.83 
 
 
673 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  38 
 
 
699 aa  332  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  42.2 
 
 
690 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  30.58 
 
 
643 aa  317  3e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.47 
 
 
671 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.43 
 
 
677 aa  297  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  33.07 
 
 
749 aa  296  6e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  34.21 
 
 
619 aa  296  9e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  35.18 
 
 
719 aa  293  5e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.47 
 
 
703 aa  291  4e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  34.19 
 
 
594 aa  289  9e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  49.05 
 
 
372 aa  287  5e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  48.42 
 
 
346 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  50 
 
 
364 aa  284  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.63 
 
 
374 aa  283  8.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.69 
 
 
373 aa  283  9e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.39 
 
 
618 aa  283  9e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.15 
 
 
369 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.95 
 
 
357 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.52 
 
 
384 aa  280  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.2 
 
 
364 aa  280  6e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.57 
 
 
383 aa  280  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.57 
 
 
383 aa  279  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  48.25 
 
 
364 aa  278  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.52 
 
 
386 aa  277  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  48.12 
 
 
347 aa  277  5e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  46.88 
 
 
351 aa  276  7e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  46.11 
 
 
345 aa  276  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  46.86 
 
 
309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.89 
 
 
391 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.52 
 
 
362 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.89 
 
 
382 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.89 
 
 
362 aa  273  6e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.89 
 
 
362 aa  273  7e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.66 
 
 
725 aa  273  9e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.2 
 
 
362 aa  273  9e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  42.77 
 
 
356 aa  272  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.74 
 
 
358 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.74 
 
 
358 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.36 
 
 
335 aa  272  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.3 
 
 
621 aa  270  5e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.52 
 
 
362 aa  270  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  46.84 
 
 
397 aa  270  7e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.89 
 
 
362 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.25 
 
 
405 aa  268  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.19 
 
 
620 aa  267  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.3 
 
 
619 aa  267  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  47.92 
 
 
365 aa  266  7e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.84 
 
 
362 aa  266  8e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.25 
 
 
362 aa  266  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.84 
 
 
362 aa  266  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.83 
 
 
727 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.67 
 
 
337 aa  266  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.63 
 
 
674 aa  265  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  46.69 
 
 
337 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  47.96 
 
 
333 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.2 
 
 
386 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  46.93 
 
 
342 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  48.4 
 
 
337 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.45 
 
 
618 aa  262  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.94 
 
 
616 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  48.04 
 
 
340 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  48.4 
 
 
337 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.39 
 
 
618 aa  258  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.9 
 
 
351 aa  258  3e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  46.32 
 
 
344 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  45.48 
 
 
334 aa  253  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.25 
 
 
363 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  41.82 
 
 
346 aa  251  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  41.69 
 
 
443 aa  251  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3097  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.63 
 
 
333 aa  251  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  43.63 
 
 
637 aa  250  5e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>