39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3906 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0442  von Willebrand factor, type A  56.77 
 
 
646 aa  685    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0822  von Willebrand factor type A  84.81 
 
 
665 aa  1044    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0933  von Willebrand factor type A  61.04 
 
 
661 aa  765    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8560  hypothetical protein  59.45 
 
 
648 aa  718    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1893  von Willebrand factor, type A  61.18 
 
 
662 aa  777    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.376882  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3115  von Willebrand factor type A  59.67 
 
 
653 aa  703    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.905029  hitchhiker  0.0000163012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1053  von Willebrand factor type A  61.61 
 
 
655 aa  740    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.463528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3906  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
664 aa  1301    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0145904  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2193  von Willebrand factor type A  51.15 
 
 
648 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1094  von Willebrand factor type A  51.31 
 
 
674 aa  575  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.723925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0550  von Willebrand factor type A  50.15 
 
 
647 aa  561  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4693  von Willebrand factor, type A  46.82 
 
 
665 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.93356  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4313  von Willebrand factor, type A  46.67 
 
 
665 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.844585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4399  von Willebrand factor, type A  46.67 
 
 
665 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471327  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1379  von Willebrand factor type A  46.89 
 
 
667 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1878  von Willebrand factor, type A  47.6 
 
 
658 aa  545  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0679777 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3298  von Willebrand factor type A  45.55 
 
 
663 aa  540  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10977  hypothetical protein  48.56 
 
 
672 aa  529  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.765365  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1770  von Willebrand factor type A  49.17 
 
 
666 aa  529  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000116678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4853  von Willebrand factor, type A  45.59 
 
 
668 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381001 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1987  von Willebrand factor, type A  48.64 
 
 
667 aa  519  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0953  von Willebrand factor, type A  45.58 
 
 
670 aa  462  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22290  uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  44.53 
 
 
654 aa  462  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.174866  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1871  von Willebrand factor type A (vWA) domain protein-like protein  33.29 
 
 
680 aa  372  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0310  von Willebrand factor type A  34.43 
 
 
648 aa  243  1e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2602  von Willebrand factor type A  31.81 
 
 
366 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3257  von Willebrand factor, type A  27.84 
 
 
415 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.382216  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0340  hypothetical protein  29.87 
 
 
367 aa  137  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000105714  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0521  von Willebrand factor type A  30.82 
 
 
382 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5786  hypothetical protein  29.19 
 
 
369 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115638  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3740  hypothetical protein  29.39 
 
 
338 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0371  von Willebrand factor type A  29.58 
 
 
365 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0306  von Willebrand factor, type A  28.99 
 
 
404 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.813873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4670  putative uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain  26.12 
 
 
366 aa  119  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  hitchhiker  0.00000104665 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08796  hypothetical protein  27.37 
 
 
372 aa  116  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4337  von Willebrand factor type A (vWA)domain-containing protein  27.8 
 
 
372 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2430  von Willebrand factor type A  27.97 
 
 
406 aa  106  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1092  putative cytoplasmic protein  28.27 
 
 
407 aa  105  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.64 
 
 
673 aa  45.4  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>