More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1621 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  100 
 
 
699 aa  1343    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  60.25 
 
 
705 aa  682    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  61.67 
 
 
673 aa  701    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  59.51 
 
 
674 aa  691    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  64.08 
 
 
653 aa  742    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  56.89 
 
 
719 aa  604  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  57.24 
 
 
674 aa  598  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  59.22 
 
 
657 aa  589  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  56.67 
 
 
713 aa  588  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  57.14 
 
 
738 aa  566  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.58 
 
 
622 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.58 
 
 
622 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.58 
 
 
622 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  53.91 
 
 
680 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  50.44 
 
 
629 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  58.75 
 
 
690 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  49.5 
 
 
638 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.72 
 
 
688 aa  489  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  52.48 
 
 
618 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  48.42 
 
 
626 aa  485  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  45.49 
 
 
637 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.22 
 
 
674 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  40.03 
 
 
680 aa  444  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  42.34 
 
 
696 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  39.92 
 
 
669 aa  422  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  64.67 
 
 
788 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  40.36 
 
 
653 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  38.3 
 
 
614 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  64.37 
 
 
616 aa  399  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  66.37 
 
 
776 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  69.16 
 
 
730 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  38.34 
 
 
650 aa  374  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  55.03 
 
 
364 aa  347  4e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.29 
 
 
374 aa  334  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  53.62 
 
 
364 aa  329  8e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.92 
 
 
373 aa  327  5e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.54 
 
 
358 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.54 
 
 
358 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  39 
 
 
719 aa  320  7e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  52.51 
 
 
372 aa  318  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.24 
 
 
362 aa  318  3e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.18 
 
 
357 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  52.31 
 
 
346 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  48.31 
 
 
362 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3462  magnesium chelatase ChlI subunit  37.86 
 
 
754 aa  313  7.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.05 
 
 
337 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  51.34 
 
 
351 aa  313  9e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  52.1 
 
 
347 aa  312  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.2 
 
 
405 aa  313  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.48 
 
 
369 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.43 
 
 
364 aa  311  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  50.45 
 
 
345 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.29 
 
 
337 aa  310  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  48 
 
 
362 aa  309  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.34 
 
 
362 aa  309  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  48 
 
 
362 aa  309  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.68 
 
 
337 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.37 
 
 
337 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  48.39 
 
 
337 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  50.46 
 
 
363 aa  306  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.82 
 
 
394 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  51.23 
 
 
334 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  47.69 
 
 
362 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  47.69 
 
 
362 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  47.69 
 
 
362 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  47.38 
 
 
362 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.53 
 
 
391 aa  301  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  44.68 
 
 
356 aa  300  8e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  49.55 
 
 
346 aa  299  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.53 
 
 
382 aa  297  6e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.84 
 
 
336 aa  296  8e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.66 
 
 
384 aa  293  8e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.4 
 
 
383 aa  293  9e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  46.93 
 
 
397 aa  292  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.82 
 
 
386 aa  292  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  32.51 
 
 
594 aa  291  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.07 
 
 
340 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.01 
 
 
379 aa  289  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.15 
 
 
340 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.4 
 
 
348 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.61 
 
 
370 aa  287  5.999999999999999e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  50.31 
 
 
334 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.22 
 
 
383 aa  286  8e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.13 
 
 
377 aa  286  8e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  49.54 
 
 
334 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  50 
 
 
341 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  50.31 
 
 
334 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.76 
 
 
368 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  46.34 
 
 
443 aa  282  1e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.24 
 
 
386 aa  280  7e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  46.3 
 
 
637 aa  279  1e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  48.65 
 
 
365 aa  278  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  46.3 
 
 
637 aa  279  2e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.93 
 
 
340 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.18 
 
 
341 aa  276  9e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  47.81 
 
 
340 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  50.47 
 
 
689 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.62 
 
 
335 aa  275  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.38 
 
 
677 aa  273  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.32 
 
 
340 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>