More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0879 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
310 aa  618  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.88 
 
 
324 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  58.27 
 
 
620 aa  269  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.28 
 
 
297 aa  251  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  31.95 
 
 
318 aa  95.9  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  34.22 
 
 
332 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  29.41 
 
 
320 aa  92.8  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  32.51 
 
 
308 aa  89.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.96 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08430  MoxR-like ATPase  34.04 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  32.63 
 
 
317 aa  87  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  32.63 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  26.69 
 
 
308 aa  86.7  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  31.52 
 
 
320 aa  86.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.16 
 
 
356 aa  86.3  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.27 
 
 
324 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.96 
 
 
324 aa  86.3  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.92 
 
 
378 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.94 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  29.61 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2472  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.52 
 
 
335 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.83519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  33.9 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  28.93 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  34.22 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  32.61 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  25.88 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  32.85 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.52 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  29.07 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.71 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.64 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  27.23 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  27.23 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  27.23 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  27.23 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  27.23 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  27.23 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31 
 
 
396 aa  82.4  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  29.19 
 
 
360 aa  82.4  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  30.71 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  31.55 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.75 
 
 
306 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  27.23 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  32.98 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  27.42 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  31.75 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  27.23 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  29.47 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  26.34 
 
 
297 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.85 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  31.36 
 
 
365 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.9 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.5 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.55 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  32.68 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  29.3 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.24 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  30.85 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  26.34 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  28.5 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.38 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.73 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.74 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0862  ATPase  30.43 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0166086  normal  0.0307461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.43 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  34.24 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.29 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  25.94 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  33.33 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.82 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  29.6 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.92 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.2 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  32.2 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.28 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.69 
 
 
363 aa  79.3  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  28.04 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  28.29 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.95 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  32.11 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  30.77 
 
 
303 aa  79  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.02 
 
 
380 aa  79  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.78 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.08 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.91 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1942  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.37 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  32.97 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  32.77 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.32 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.98 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  27.51 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4249  ATPase  31.46 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.72 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.02 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  29.84 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  30 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1319  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.72 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1196  ATPase  32.95 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160899  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  29.8 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  31.61 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>