More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3626 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  100 
 
 		 308 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  79.22 
 
 		 305 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  71.95 
 
 		 321 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  71.62 
 
 		 323 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  71.62 
 
 		 323 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.92 
 
 		 331 aa  344  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  57.05 
 
 		 303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  57.95 
 
 		 315 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  60.36 
 
 		 303 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  56.86 
 
 		 303 aa  333  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  57.99 
 
 		 306 aa  331  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  58.9 
 
 		 306 aa  328  7e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  54.61 
 
 		 303 aa  328  7e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  57 
 
 		 303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  58.74 
 
 		 317 aa  325  6e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  55.18 
 
 		 303 aa  324  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  58.39 
 
 		 317 aa  323  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  56.07 
 
 		 302 aa  323  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  58.72 
 
 		 306 aa  322  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  62.07 
 
 		 306 aa  322  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  60.66 
 
 		 315 aa  322  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  55.67 
 
 		 303 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  59.65 
 
 		 313 aa  322  7e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  55.67 
 
 		 303 aa  321  8e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  59.65 
 
 		 303 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  56.15 
 
 		 309 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  61.51 
 
 		 306 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  59.3 
 
 		 303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  53.7 
 
 		 350 aa  319  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  58.19 
 
 		 303 aa  318  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  59.04 
 
 		 303 aa  318  6e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  58.66 
 
 		 308 aa  318  6e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  60.47 
 
 		 317 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.54 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  56.52 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  55.33 
 
 		 303 aa  316  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.88 
 
 		 306 aa  316  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  57.54 
 
 		 303 aa  315  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  57.54 
 
 		 303 aa  315  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  56.1 
 
 		 315 aa  315  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  59.85 
 
 		 306 aa  315  8e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  60.45 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  60.82 
 
 		 349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.3 
 
 		 329 aa  312  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.68 
 
 		 300 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  54.42 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  65.41 
 
 		 305 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.16 
 
 		 317 aa  308  5.9999999999999995e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  53.18 
 
 		 305 aa  308  5.9999999999999995e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  55.86 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  62.54 
 
 		 305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  65.04 
 
 		 305 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.89 
 
 		 308 aa  305  7e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.55 
 
 		 306 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  56.55 
 
 		 306 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  55.78 
 
 		 310 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  53.07 
 
 		 304 aa  295  9e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  52.71 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  58.72 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  58.06 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  58.01 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.36 
 
 		 341 aa  289  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  52.44 
 
 		 335 aa  287  1e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  51.78 
 
 		 335 aa  287  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  48 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  54.85 
 
 		 317 aa  281  9e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  47.56 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  52.2 
 
 		 350 aa  277  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2054  MoxR-like ATPases  50 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0418936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.56 
 
 		 333 aa  276  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.92 
 
 		 325 aa  276  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.53 
 
 		 305 aa  275  6e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.63 
 
 		 319 aa  275  7e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  42.48 
 
 		 312 aa  275  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  51.75 
 
 		 350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.02 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  45.85 
 
 		 308 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  48.38 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  47.46 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  51.49 
 
 		 326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.67 
 
 		 354 aa  272  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  46.46 
 
 		 316 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  47.08 
 
 		 323 aa  271  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  40.33 
 
 		 318 aa  271  7e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  50 
 
 		 359 aa  271  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1319  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.7 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.51 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  49.84 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  46.86 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.56 
 
 		 305 aa  269  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.65 
 
 		 325 aa  269  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  49.5 
 
 		 328 aa  269  5e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1696  MoxR family protein  49.68 
 
 		 313 aa  268  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  49.19 
 
 		 331 aa  268  7e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.23 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  46.18 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.62 
 
 		 332 aa  267  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.05 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  48.01 
 
 		 320 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0244159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>