More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3377 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 		 306 aa  614  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  81.37 
 
 		 306 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  80.98 
 
 		 306 aa  513  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  79.74 
 
 		 306 aa  504  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  79.08 
 
 		 306 aa  502  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  81.37 
 
 		 306 aa  498  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  83.33 
 
 		 310 aa  497  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  81.37 
 
 		 306 aa  498  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  71.24 
 
 		 306 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  75.08 
 
 		 306 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  65.15 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  60.74 
 
 		 303 aa  357  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  58.33 
 
 		 303 aa  349  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.13 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  59.41 
 
 		 315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  55.7 
 
 		 315 aa  335  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  58.8 
 
 		 305 aa  329  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  58.14 
 
 		 305 aa  328  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  58.14 
 
 		 305 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  57.67 
 
 		 315 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  58.53 
 
 		 305 aa  325  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  58.53 
 
 		 305 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  55.25 
 
 		 317 aa  324  1e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  55.87 
 
 		 302 aa  323  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  54.92 
 
 		 317 aa  322  4e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  54.51 
 
 		 306 aa  322  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.27 
 
 		 317 aa  321  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  54.95 
 
 		 308 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  55.88 
 
 		 308 aa  316  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  52.61 
 
 		 305 aa  315  5e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  54.67 
 
 		 306 aa  315  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  54.68 
 
 		 303 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  53.62 
 
 		 303 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.88 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  54.72 
 
 		 305 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  54.51 
 
 		 303 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  59.71 
 
 		 312 aa  312  5.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  54.15 
 
 		 303 aa  309  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  54.35 
 
 		 303 aa  308  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  57.43 
 
 		 317 aa  308  5.9999999999999995e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  55.68 
 
 		 303 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  53.99 
 
 		 303 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  53.99 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  54.28 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.39 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  53.9 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  56.65 
 
 		 303 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  54.38 
 
 		 315 aa  302  6.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  53.43 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  56.65 
 
 		 303 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  56.27 
 
 		 303 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  56.27 
 
 		 313 aa  299  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  54.75 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  54.75 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.88 
 
 		 329 aa  296  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  53.02 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  51.99 
 
 		 315 aa  296  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  45.45 
 
 		 310 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  52.5 
 
 		 309 aa  295  5e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.97 
 
 		 323 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.97 
 
 		 323 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.37 
 
 		 303 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  59.71 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.05 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.52 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  50.67 
 
 		 350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  49.67 
 
 		 331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  46.52 
 
 		 308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  50.32 
 
 		 331 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.95 
 
 		 314 aa  282  5.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  47.69 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.46 
 
 		 313 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  49.64 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  50.68 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.65 
 
 		 322 aa  278  9e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.87 
 
 		 316 aa  278  9e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  51.74 
 
 		 317 aa  277  1e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.74 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  42.58 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  47.69 
 
 		 323 aa  275  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  46.89 
 
 		 314 aa  275  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 		 309 aa  275  7e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.19 
 
 		 337 aa  275  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.22 
 
 		 306 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.22 
 
 		 306 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  48.21 
 
 		 310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  48.48 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.71 
 
 		 341 aa  273  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.19 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.62 
 
 		 320 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  45 
 
 		 316 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0240  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.04 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.288695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  47.99 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  48.35 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  49.62 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.62 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.46 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  47.62 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  47.46 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0659  ATPase  48.65 
 
 		 341 aa  270  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.936381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>