More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1219 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  92.48 
 
 
306 aa  580  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  83.33 
 
 
306 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  80.07 
 
 
306 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  79.02 
 
 
306 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  80.39 
 
 
306 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  80.39 
 
 
306 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  78.43 
 
 
306 aa  494  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  75.74 
 
 
306 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  71.9 
 
 
306 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  67 
 
 
349 aa  368  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  57.48 
 
 
303 aa  341  7e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.17 
 
 
331 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  56.57 
 
 
303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  57.67 
 
 
315 aa  326  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  56.69 
 
 
315 aa  326  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  53.95 
 
 
302 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  54.42 
 
 
317 aa  322  6e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  54.08 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  54.4 
 
 
306 aa  318  5e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  55.16 
 
 
315 aa  318  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.48 
 
 
300 aa  316  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.16 
 
 
317 aa  316  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  51.82 
 
 
308 aa  315  7e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  56.44 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  55.07 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  54.84 
 
 
303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  57.38 
 
 
305 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  56.15 
 
 
305 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  56.52 
 
 
305 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  53.9 
 
 
303 aa  311  9e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  58.59 
 
 
312 aa  310  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  54.09 
 
 
306 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  56.39 
 
 
305 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  50.85 
 
 
303 aa  309  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  55.78 
 
 
308 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  54.95 
 
 
303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  50.83 
 
 
305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  53.11 
 
 
303 aa  306  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.45 
 
 
308 aa  305  7e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  55.16 
 
 
335 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  54.73 
 
 
305 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  53.48 
 
 
303 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  53.48 
 
 
303 aa  301  9e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  52.46 
 
 
315 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  54.15 
 
 
304 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  55.2 
 
 
335 aa  300  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  56.62 
 
 
317 aa  300  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  45.66 
 
 
310 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  53.6 
 
 
309 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  54.81 
 
 
304 aa  299  4e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  55.51 
 
 
303 aa  298  6e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.63 
 
 
323 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.63 
 
 
323 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.31 
 
 
329 aa  296  4e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  53.99 
 
 
303 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  53.99 
 
 
303 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  55.51 
 
 
303 aa  295  8e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.99 
 
 
303 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  51.17 
 
 
315 aa  294  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  55.13 
 
 
303 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  55.13 
 
 
313 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  54.95 
 
 
321 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.12 
 
 
309 aa  292  6e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.22 
 
 
305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  44.85 
 
 
308 aa  288  6e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  46.75 
 
 
347 aa  285  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.25 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.84 
 
 
306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.69 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.34 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.11 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.11 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  47.08 
 
 
323 aa  281  8.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  46.33 
 
 
316 aa  280  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  51.35 
 
 
326 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  42.9 
 
 
312 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.33 
 
 
314 aa  279  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  47.68 
 
 
305 aa  278  9e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  48.68 
 
 
350 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  47.57 
 
 
327 aa  277  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.17 
 
 
322 aa  277  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  47.29 
 
 
314 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.54 
 
 
325 aa  277  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.18 
 
 
302 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  49.46 
 
 
305 aa  276  3e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  52.23 
 
 
317 aa  276  4e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  49.01 
 
 
331 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.64 
 
 
316 aa  275  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  49.1 
 
 
320 aa  275  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.19 
 
 
319 aa  275  9e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.34 
 
 
341 aa  275  9e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  46.31 
 
 
320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  48.03 
 
 
331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1696  MoxR family protein  47.76 
 
 
313 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.51 
 
 
354 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  47.02 
 
 
310 aa  273  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50.94 
 
 
320 aa  272  6e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  50 
 
 
310 aa  271  8.000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  50.94 
 
 
320 aa  271  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>