More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03013 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  630  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  91.95 
 
 		 323 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  91.95 
 
 		 323 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  76.51 
 
 		 305 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  71.95 
 
 		 308 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.23 
 
 		 331 aa  363  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  62.5 
 
 		 306 aa  351  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  60 
 
 		 302 aa  344  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  60.07 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  57.53 
 
 		 303 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  63.14 
 
 		 303 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  56.71 
 
 		 303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  58.13 
 
 		 303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  53.97 
 
 		 315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  55.41 
 
 		 303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  59.59 
 
 		 303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  64.67 
 
 		 305 aa  334  9e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  64.67 
 
 		 305 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  56.52 
 
 		 303 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  58.09 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  60.7 
 
 		 303 aa  332  4e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  60.35 
 
 		 313 aa  332  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  59.41 
 
 		 303 aa  332  5e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  56.19 
 
 		 317 aa  332  6e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  60.35 
 
 		 303 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  57.78 
 
 		 306 aa  332  7.000000000000001e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.56 
 
 		 317 aa  331  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  61.59 
 
 		 317 aa  331  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  59.93 
 
 		 303 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  55.87 
 
 		 317 aa  330  2e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  56.57 
 
 		 315 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  64.63 
 
 		 305 aa  328  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.95 
 
 		 303 aa  328  8e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  56.04 
 
 		 303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  57.95 
 
 		 303 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  57.95 
 
 		 303 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.49 
 
 		 329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  60.62 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  60.44 
 
 		 306 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  61.41 
 
 		 315 aa  322  8e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  58.36 
 
 		 306 aa  322  8e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  56.25 
 
 		 303 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  60.58 
 
 		 315 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  59.34 
 
 		 306 aa  318  7.999999999999999e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  56.36 
 
 		 350 aa  317  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  52.61 
 
 		 315 aa  317  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  59.56 
 
 		 306 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.01 
 
 		 300 aa  315  6e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  55.56 
 
 		 306 aa  315  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  61.09 
 
 		 349 aa  314  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.71 
 
 		 306 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  59.46 
 
 		 305 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.36 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  59.12 
 
 		 305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.71 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  59.71 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  52.84 
 
 		 304 aa  306  3e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  56.52 
 
 		 312 aa  306  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  52.51 
 
 		 304 aa  305  6e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  52.54 
 
 		 305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  54.95 
 
 		 310 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.41 
 
 		 305 aa  302  5.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  58.65 
 
 		 317 aa  301  9e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  51.35 
 
 		 335 aa  296  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  44.88 
 
 		 312 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.32 
 
 		 341 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  48.03 
 
 		 310 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  50.68 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.59 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  50.15 
 
 		 335 aa  290  3e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.2 
 
 		 319 aa  288  8e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  53.82 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  51.82 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.52 
 
 		 313 aa  286  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  51.9 
 
 		 350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.35 
 
 		 354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.86 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  49.66 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3209  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.99 
 
 		 339 aa  279  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00106546  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.65 
 
 		 325 aa  279  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  53.51 
 
 		 331 aa  279  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.67 
 
 		 302 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  48.22 
 
 		 323 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  52.77 
 
 		 331 aa  278  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.44 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  47.71 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  49.16 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  51.21 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  50.92 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  50 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.64 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.86 
 
 		 332 aa  276  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.35 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.22 
 
 		 335 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1090  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.13 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.52 
 
 		 337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  49.63 
 
 		 310 aa  272  5.000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2420  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.58 
 
 		 325 aa  272  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  41.52 
 
 		 318 aa  272  7e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.45 
 
 		 306 aa  271  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>