More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2530 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  100 
 
 		 303 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  75.5 
 
 		 303 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  75 
 
 		 315 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  75.17 
 
 		 303 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  74.5 
 
 		 303 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  74.83 
 
 		 303 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  72.85 
 
 		 303 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  75.17 
 
 		 303 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  73.18 
 
 		 303 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  75.17 
 
 		 303 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  75.17 
 
 		 303 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  74.3 
 
 		 303 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  74.3 
 
 		 303 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  74.65 
 
 		 303 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  75 
 
 		 313 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  68.77 
 
 		 309 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  70.2 
 
 		 303 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  59.74 
 
 		 305 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  62.91 
 
 		 312 aa  362  6e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  54.1 
 
 		 350 aa  348  9e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  58.48 
 
 		 306 aa  342  5e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  55.41 
 
 		 315 aa  341  9e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  55.82 
 
 		 317 aa  337  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  55.48 
 
 		 317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  53.18 
 
 		 303 aa  335  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  55.67 
 
 		 308 aa  334  9e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.01 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  54.48 
 
 		 305 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  51.66 
 
 		 306 aa  329  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  54.61 
 
 		 308 aa  328  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  55.83 
 
 		 303 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.77 
 
 		 300 aa  324  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  55.29 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  55.2 
 
 		 306 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  56.27 
 
 		 335 aa  320  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  50.34 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  55.56 
 
 		 335 aa  316  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  56.4 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  52.86 
 
 		 306 aa  316  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  55.56 
 
 		 305 aa  315  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  55.56 
 
 		 305 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.68 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  56.79 
 
 		 315 aa  311  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.5 
 
 		 329 aa  311  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  50.99 
 
 		 306 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  55.43 
 
 		 304 aa  308  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  55.8 
 
 		 304 aa  308  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  50.9 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  55.07 
 
 		 306 aa  305  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.96 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  49.11 
 
 		 305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  52.5 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  48.75 
 
 		 305 aa  300  3e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.99 
 
 		 313 aa  299  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  55.59 
 
 		 305 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.9 
 
 		 308 aa  298  7e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  56.25 
 
 		 321 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  55.59 
 
 		 305 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  54.92 
 
 		 315 aa  296  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.97 
 
 		 305 aa  296  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.24 
 
 		 323 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  54.84 
 
 		 310 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.24 
 
 		 323 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  48.4 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  46.96 
 
 		 347 aa  295  5e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.79 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  51.79 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  51.79 
 
 		 317 aa  292  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  46.59 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  49.31 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  50.58 
 
 		 310 aa  289  4e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  46.69 
 
 		 320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  46.69 
 
 		 320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.46 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.84 
 
 		 318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.4 
 
 		 319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  45.42 
 
 		 308 aa  285  5e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  51.43 
 
 		 349 aa  285  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.38 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  45.02 
 
 		 314 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.83 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  47.83 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.46 
 
 		 320 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  49.25 
 
 		 317 aa  282  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.45 
 
 		 341 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.14 
 
 		 316 aa  281  7.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.55 
 
 		 320 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.02 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  45.74 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  43.49 
 
 		 319 aa  279  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  47.79 
 
 		 316 aa  278  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  46.38 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  46.38 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  46.38 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.79 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.09 
 
 		 314 aa  275  7e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  44.33 
 
 		 320 aa  275  9e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  46.24 
 
 		 317 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  45.88 
 
 		 310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  45.88 
 
 		 302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>