More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5567 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  100 
 
 
305 aa  603  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  79.22 
 
 
308 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  76.51 
 
 
321 aa  407  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  75.84 
 
 
323 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  75.84 
 
 
323 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.27 
 
 
331 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  58.9 
 
 
302 aa  341  9e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  59.03 
 
 
315 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  56.95 
 
 
303 aa  335  5e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  61.22 
 
 
306 aa  332  7.000000000000001e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  54.48 
 
 
303 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  56.55 
 
 
303 aa  330  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  57.99 
 
 
309 aa  328  7e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.07 
 
 
300 aa  328  7e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  60 
 
 
303 aa  326  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  55.97 
 
 
350 aa  326  4.0000000000000003e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  60.64 
 
 
303 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  60.28 
 
 
303 aa  325  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  64.16 
 
 
305 aa  325  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  60.28 
 
 
313 aa  325  5e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  56.27 
 
 
303 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  54.73 
 
 
303 aa  322  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  57.04 
 
 
306 aa  322  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  63.82 
 
 
305 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  56.27 
 
 
303 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  58.48 
 
 
303 aa  321  8e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  57 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  61.29 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.94 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  62.71 
 
 
305 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  61.67 
 
 
317 aa  319  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  56.67 
 
 
317 aa  318  6e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  56.95 
 
 
306 aa  318  7e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  57.19 
 
 
308 aa  318  9e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  57.43 
 
 
303 aa  317  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  56.55 
 
 
303 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.45 
 
 
303 aa  316  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  54.52 
 
 
306 aa  316  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  56.8 
 
 
306 aa  316  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  57.61 
 
 
306 aa  315  8e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  55.91 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  55.56 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  57.45 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  57.45 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.72 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  62.02 
 
 
315 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.14 
 
 
317 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  56.85 
 
 
306 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  60.54 
 
 
305 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  59.86 
 
 
305 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  52.86 
 
 
305 aa  309  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  54.15 
 
 
315 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  59.71 
 
 
306 aa  305  6e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  60.34 
 
 
349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.85 
 
 
306 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  53.85 
 
 
306 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  51.01 
 
 
304 aa  302  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  51.34 
 
 
304 aa  302  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.33 
 
 
308 aa  298  7e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  57.24 
 
 
312 aa  297  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  54.73 
 
 
310 aa  289  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.43 
 
 
305 aa  288  6e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  54.67 
 
 
317 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.71 
 
 
341 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  53.38 
 
 
335 aa  281  9e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.29 
 
 
354 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.08 
 
 
313 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.54 
 
 
319 aa  279  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
325 aa  278  6e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  52.67 
 
 
335 aa  277  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  51.18 
 
 
359 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  53.08 
 
 
328 aa  277  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  50.49 
 
 
326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4605  ATPase  52.16 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.97 
 
 
330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  47.46 
 
 
310 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  43.23 
 
 
312 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  47.35 
 
 
319 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.23 
 
 
319 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.33 
 
 
318 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  48.16 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.72 
 
 
309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  50.53 
 
 
317 aa  268  8.999999999999999e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  50.16 
 
 
331 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  50.18 
 
 
331 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.46 
 
 
335 aa  267  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  49.51 
 
 
331 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.21 
 
 
351 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1331  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.63 
 
 
324 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280532  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  50.74 
 
 
310 aa  267  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.55 
 
 
333 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  45.56 
 
 
308 aa  266  4e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.38 
 
 
332 aa  265  8e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  48.82 
 
 
347 aa  264  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.33 
 
 
343 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2054  MoxR-like ATPases  49.48 
 
 
312 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0418936  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  42.5 
 
 
318 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  48.67 
 
 
320 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.585917 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  46.13 
 
 
457 aa  262  6e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  48.67 
 
 
320 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0244159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>