More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1323 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
308 aa  615  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  59.41 
 
 
303 aa  338  8e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  62.37 
 
 
306 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  58.17 
 
 
306 aa  335  7e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  54.67 
 
 
304 aa  331  1e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  54.33 
 
 
304 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  59.71 
 
 
306 aa  329  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  57.24 
 
 
302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  59.26 
 
 
303 aa  326  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  60.56 
 
 
306 aa  325  7e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.49 
 
 
306 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  58.25 
 
 
308 aa  322  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.89 
 
 
300 aa  322  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  59.07 
 
 
306 aa  322  6e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  60.26 
 
 
315 aa  321  8e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  55.83 
 
 
306 aa  321  8e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.67 
 
 
331 aa  320  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  51.66 
 
 
303 aa  319  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  61.22 
 
 
317 aa  318  7e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  59.06 
 
 
315 aa  318  7.999999999999999e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  56.31 
 
 
305 aa  317  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  55.67 
 
 
305 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.12 
 
 
317 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  58.1 
 
 
312 aa  316  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  57.04 
 
 
306 aa  316  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  56.18 
 
 
306 aa  315  5e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  54.01 
 
 
303 aa  315  5e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  51.84 
 
 
303 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  52.56 
 
 
303 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  63.37 
 
 
315 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  58.16 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  52.48 
 
 
317 aa  311  9e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  61.07 
 
 
321 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  52.15 
 
 
317 aa  310  2e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  52.32 
 
 
309 aa  310  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  55.4 
 
 
315 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  53.42 
 
 
308 aa  308  6.999999999999999e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.54 
 
 
306 aa  308  8e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  56.54 
 
 
306 aa  308  8e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  53 
 
 
303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  52.96 
 
 
315 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  60.28 
 
 
305 aa  305  7e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  60.28 
 
 
305 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  58.05 
 
 
305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  51.83 
 
 
303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  59.46 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.58 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  52.82 
 
 
303 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  54.74 
 
 
303 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.62 
 
 
323 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  51.83 
 
 
303 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.62 
 
 
323 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  60.78 
 
 
349 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  57.05 
 
 
305 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  54.74 
 
 
303 aa  299  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  54.39 
 
 
303 aa  298  5e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  54.39 
 
 
313 aa  298  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.63 
 
 
303 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  52.28 
 
 
303 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  52.28 
 
 
303 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  47.29 
 
 
350 aa  289  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  54.08 
 
 
317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  44.3 
 
 
312 aa  285  7e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.93 
 
 
319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  52.28 
 
 
335 aa  282  5.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  47.59 
 
 
310 aa  281  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  51.23 
 
 
335 aa  279  4e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.58 
 
 
305 aa  277  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  50.5 
 
 
328 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.32 
 
 
341 aa  275  8e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.18 
 
 
325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  47.87 
 
 
319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  47.92 
 
 
347 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.58 
 
 
318 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  52.52 
 
 
326 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  44.44 
 
 
314 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.71 
 
 
343 aa  270  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.829729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1319  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.31 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  48.96 
 
 
327 aa  268  7e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.24 
 
 
330 aa  267  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47 
 
 
316 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.73 
 
 
321 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  46.38 
 
 
302 aa  267  2e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.9 
 
 
313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.96 
 
 
305 aa  265  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.53 
 
 
314 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  44.74 
 
 
310 aa  265  8e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  44.19 
 
 
313 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.06 
 
 
325 aa  264  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2106  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.13 
 
 
326 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  47.33 
 
 
323 aa  263  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  47.58 
 
 
320 aa  263  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  38.98 
 
 
318 aa  262  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  42.05 
 
 
308 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.21 
 
 
320 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2054  MoxR-like ATPases  48.14 
 
 
312 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0418936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  46.84 
 
 
320 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  44.05 
 
 
316 aa  260  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4605  ATPase  47.18 
 
 
323 aa  260  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  48.24 
 
 
331 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>