61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2042 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  100 
 
 
396 aa  815    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  46.25 
 
 
371 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  46.5 
 
 
371 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  31.07 
 
 
383 aa  142  9e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  31.71 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  30.61 
 
 
328 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  28.69 
 
 
351 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  28.69 
 
 
351 aa  110  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  27.19 
 
 
360 aa  109  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  23.73 
 
 
352 aa  97.4  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  26.84 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  27.3 
 
 
331 aa  92.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  23.55 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  27.6 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.06 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24 
 
 
327 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  23.94 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.21 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  23.83 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.1 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  27.33 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  23.96 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  28.82 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.09 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.25 
 
 
364 aa  69.3  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  22.97 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  25.86 
 
 
342 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  29.94 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  22.9 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  28.14 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  28.14 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.22 
 
 
521 aa  64.7  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  28.5 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  28.65 
 
 
348 aa  63.2  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  24.17 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  28.14 
 
 
372 aa  61.6  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  24.17 
 
 
332 aa  59.7  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.53 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  20.91 
 
 
367 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.18 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.79 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  25.57 
 
 
353 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  25.26 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  25 
 
 
353 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.27 
 
 
372 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  22.56 
 
 
489 aa  54.7  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  22.64 
 
 
505 aa  53.1  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  27.33 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  26.09 
 
 
368 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  27.33 
 
 
369 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  24.4 
 
 
354 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  27.95 
 
 
369 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  24.4 
 
 
354 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  30.38 
 
 
368 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.95 
 
 
418 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  21.43 
 
 
368 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  21.43 
 
 
368 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.43 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  28.07 
 
 
369 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  21.69 
 
 
341 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.54 
 
 
350 aa  43.9  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>