120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1812 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  100 
 
 
351 aa  709    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  99.43 
 
 
351 aa  705    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  58.64 
 
 
352 aa  435  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  59.15 
 
 
328 aa  421  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  56.45 
 
 
360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  44.98 
 
 
302 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  30.56 
 
 
353 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  30.54 
 
 
353 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  29.43 
 
 
353 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  29.53 
 
 
353 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  29.32 
 
 
371 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  28.95 
 
 
371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  32 
 
 
355 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  31.91 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.99 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  32.31 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  30.1 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  28.69 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  30.84 
 
 
379 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  30.84 
 
 
372 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.28 
 
 
354 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  34.71 
 
 
347 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  28.83 
 
 
353 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  36.9 
 
 
348 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  33.16 
 
 
387 aa  103  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  33.49 
 
 
332 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  27.86 
 
 
383 aa  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.69 
 
 
347 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.88 
 
 
330 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  31.15 
 
 
379 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.43 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  29.55 
 
 
372 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  32.44 
 
 
342 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  31.84 
 
 
368 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  32.16 
 
 
340 aa  96.3  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  31.05 
 
 
372 aa  96.3  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  32.26 
 
 
332 aa  95.9  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  36.13 
 
 
369 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  30.67 
 
 
331 aa  92  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.76 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  30.94 
 
 
369 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  28.79 
 
 
381 aa  89.4  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  29.6 
 
 
369 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  32.58 
 
 
354 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  32.58 
 
 
354 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  29.7 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  29.15 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.28 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  28.25 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  28.24 
 
 
368 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  28.24 
 
 
368 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  30.5 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.3 
 
 
360 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  27.48 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  27.7 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  27.95 
 
 
362 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  25.57 
 
 
489 aa  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  25.77 
 
 
505 aa  63.9  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.13 
 
 
372 aa  63.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.5 
 
 
361 aa  62.8  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  26.06 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2360  hypothetical protein  24.02 
 
 
359 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.615726  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  25.71 
 
 
379 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  24.55 
 
 
412 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.9 
 
 
521 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.93 
 
 
398 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.81 
 
 
414 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.87 
 
 
418 aa  53.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  28 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  31.72 
 
 
674 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  30.47 
 
 
362 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  31.03 
 
 
674 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  31.03 
 
 
674 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  29.6 
 
 
306 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.66 
 
 
382 aa  47  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2426  ATPase  28.99 
 
 
314 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  25.33 
 
 
303 aa  46.2  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  25.81 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  25.81 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2054  MoxR-like ATPases  27.56 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0418936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1760  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  38.89 
 
 
769 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0476862  normal  0.109361 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  30.66 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  30 
 
 
308 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2044  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.63 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.97 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0464  ATP-dependent Clp protease  33.33 
 
 
759 aa  45.1  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.921546  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3324  ATPase AAA-2  33.67 
 
 
802 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.660332  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  26.87 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2416  ATPase AAA-2  33.67 
 
 
799 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  26.56 
 
 
303 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1667  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  32.46 
 
 
829 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.134517  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0640  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  34.71 
 
 
726 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.680329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  28.79 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  25.55 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  25.55 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  25.55 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  26.52 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  25.55 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  26.72 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.55 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>