187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0438 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  88.58 
 
 		 674 aa  1227    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  54.33 
 
 		 676 aa  780    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  57.74 
 
 		 668 aa  782    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  54.55 
 
 		 670 aa  752    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  52.89 
 
 		 676 aa  711    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  58.33 
 
 		 676 aa  783    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  54.78 
 
 		 672 aa  781    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  100 
 
 		 674 aa  1379    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  69.85 
 
 		 674 aa  993    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  86.5 
 
 		 674 aa  1201    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  55.37 
 
 		 676 aa  785    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  55.67 
 
 		 672 aa  796    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  43.02 
 
 		 710 aa  522  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  42.88 
 
 		 710 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  42.88 
 
 		 710 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  43.55 
 
 		 710 aa  511  1e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  44.39 
 
 		 717 aa  488  1e-136  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  37.34 
 
 		 724 aa  390  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  38.86 
 
 		 626 aa  392  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  38.94 
 
 		 677 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  38.94 
 
 		 677 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  37.84 
 
 		 607 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  35.02 
 
 		 700 aa  295  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  33.33 
 
 		 700 aa  293  6e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  31.66 
 
 		 696 aa  292  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  36.41 
 
 		 693 aa  292  1e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  31.3 
 
 		 700 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  33.12 
 
 		 706 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  34.3 
 
 		 717 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  33.39 
 
 		 694 aa  286  9e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  31.49 
 
 		 689 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  36.32 
 
 		 686 aa  276  9e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  33.22 
 
 		 703 aa  268  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  33.22 
 
 		 688 aa  263  8.999999999999999e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  31.26 
 
 		 695 aa  261  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  35.08 
 
 		 679 aa  252  1e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  34.92 
 
 		 680 aa  249  9e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  33.9 
 
 		 682 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  33.79 
 
 		 680 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  33.67 
 
 		 686 aa  239  9e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  32.21 
 
 		 882 aa  233  8.000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  27.3 
 
 		 667 aa  216  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  30.93 
 
 		 729 aa  214  3.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  30.71 
 
 		 739 aa  207  4e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  29.56 
 
 		 791 aa  205  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  37.09 
 
 		 873 aa  203  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  30.43 
 
 		 811 aa  201  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  26.99 
 
 		 709 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  28.36 
 
 		 710 aa  201  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  32.23 
 
 		 788 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  34.83 
 
 		 949 aa  196  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  26.99 
 
 		 761 aa  194  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  27.12 
 
 		 755 aa  194  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  29.74 
 
 		 848 aa  194  6e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  36.2 
 
 		 458 aa  193  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  28.6 
 
 		 989 aa  192  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  36.8 
 
 		 915 aa  190  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  34.94 
 
 		 963 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  29.8 
 
 		 707 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  27.5 
 
 		 932 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 1342 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  31.14 
 
 		 795 aa  186  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  34.89 
 
 		 841 aa  184  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  34.94 
 
 		 551 aa  184  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  27.37 
 
 		 675 aa  182  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  29.12 
 
 		 847 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  26.45 
 
 		 890 aa  178  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  27.68 
 
 		 796 aa  177  6e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  27.85 
 
 		 724 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 1412 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  29.03 
 
 		 618 aa  176  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  29.72 
 
 		 717 aa  176  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  27.15 
 
 		 717 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  29.47 
 
 		 876 aa  169  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  28.81 
 
 		 556 aa  167  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  26.99 
 
 		 808 aa  167  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  27.12 
 
 		 859 aa  166  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  37.41 
 
 		 1064 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  32.68 
 
 		 660 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  35.89 
 
 		 1059 aa  158  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1640  MCM family DNA replication protein  33.59 
 
 		 246 aa  133  9e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  24.22 
 
 		 487 aa  127  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  23.56 
 
 		 467 aa  103  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  25.57 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4231  putative ATP-dependent protease  30.5 
 
 		 506 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4110  putative ATP-dependent protease  30.5 
 
 		 506 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4290  putative ATP-dependent protease  30.5 
 
 		 506 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  29.05 
 
 		 506 aa  53.9  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0359252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4125  putative ATP-dependent protease  30.5 
 
 		 506 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  25.12 
 
 		 513 aa  53.9  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4182  putative ATP-dependent protease  30 
 
 		 506 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  26.13 
 
 		 506 aa  53.1  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  28.17 
 
 		 525 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  24.77 
 
 		 512 aa  52  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.01 
 
 		 621 aa  51.2  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  28.41 
 
 		 509 aa  50.8  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  28.7 
 
 		 510 aa  51.2  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  21.83 
 
 		 512 aa  51.2  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 510 aa  50.8  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  29.46 
 
 		 654 aa  50.8  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.425078 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>