204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0668 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  83.55 
 
 
382 aa  661    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  100 
 
 
390 aa  773    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.73 
 
 
387 aa  192  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  35.27 
 
 
376 aa  182  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.36 
 
 
407 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.23 
 
 
383 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  35.78 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.16 
 
 
389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.69 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  37 
 
 
509 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  36.63 
 
 
509 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  37.45 
 
 
489 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  43.48 
 
 
368 aa  163  6e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  37.83 
 
 
464 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  45.54 
 
 
368 aa  156  7e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  42.57 
 
 
368 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  35.63 
 
 
506 aa  150  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  35.02 
 
 
512 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  35.02 
 
 
512 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  35.88 
 
 
498 aa  149  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  35.02 
 
 
512 aa  149  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  43.63 
 
 
368 aa  149  9e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  36.36 
 
 
523 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  35.88 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.88 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  35.88 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  35.5 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  35.88 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  35.88 
 
 
506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  35.88 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  36.76 
 
 
468 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  36.84 
 
 
547 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  34.35 
 
 
379 aa  146  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  34.52 
 
 
553 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  33.33 
 
 
546 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  34.63 
 
 
553 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  37.34 
 
 
466 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  35.96 
 
 
498 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  33.1 
 
 
498 aa  142  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  33.57 
 
 
499 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  33.1 
 
 
552 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  33.68 
 
 
499 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  33.79 
 
 
560 aa  139  7e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.37 
 
 
436 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  33.33 
 
 
499 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.65 
 
 
477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  34.21 
 
 
498 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  36.43 
 
 
498 aa  135  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  34.21 
 
 
498 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  34.21 
 
 
498 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  34.21 
 
 
498 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  34.21 
 
 
498 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  32.45 
 
 
530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.46 
 
 
528 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.81 
 
 
526 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  32 
 
 
543 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  24.54 
 
 
309 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  22.71 
 
 
309 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.37 
 
 
318 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0039  ATPase  25.42 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.08 
 
 
327 aa  54.7  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  22.97 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  23.88 
 
 
309 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  22.73 
 
 
310 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  24.91 
 
 
335 aa  53.1  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  23.08 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  23.08 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  24.55 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  22.97 
 
 
310 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  22.38 
 
 
310 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  30.52 
 
 
327 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0879  ATPase  24.44 
 
 
334 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.714074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.39 
 
 
350 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  25 
 
 
312 aa  50.4  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0535  ATPase  24.72 
 
 
313 aa  50.4  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000789925  normal  0.392501 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  24.42 
 
 
457 aa  50.1  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  26.04 
 
 
318 aa  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.41 
 
 
342 aa  49.7  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.77 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2374  ATPase  28.11 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  28.99 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  22.56 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  23.83 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.77 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  26.83 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  28.93 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.37 
 
 
302 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.37 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.33 
 
 
325 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.57 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.42 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.76 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  27.61 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  26.83 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0818  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.76 
 
 
322 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.761606  normal  0.617267 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.76 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19020  MoxR-like ATPase  24.11 
 
 
377 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  30.95 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  27.45 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.8 
 
 
334 aa  47.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>