More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0871 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  100 
 
 
267 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  87.64 
 
 
267 aa  497  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  84.27 
 
 
267 aa  474  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  84.27 
 
 
267 aa  474  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  82.77 
 
 
267 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  82.77 
 
 
267 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  82.4 
 
 
267 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  81.27 
 
 
267 aa  467  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  83.72 
 
 
307 aa  461  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  82.56 
 
 
271 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  82.95 
 
 
278 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  81.54 
 
 
268 aa  450  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  77.07 
 
 
268 aa  438  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  77.69 
 
 
266 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  76.4 
 
 
267 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  74.62 
 
 
268 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  74.03 
 
 
269 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  72.73 
 
 
266 aa  413  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  71.16 
 
 
268 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  73.86 
 
 
272 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  71.48 
 
 
272 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  71.48 
 
 
272 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  73.64 
 
 
267 aa  402  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  71.48 
 
 
268 aa  397  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  71.88 
 
 
265 aa  388  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  67.55 
 
 
272 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  65.28 
 
 
285 aa  361  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  64.86 
 
 
266 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  61.69 
 
 
265 aa  348  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  61.3 
 
 
279 aa  345  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  62.4 
 
 
280 aa  345  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  59.47 
 
 
270 aa  337  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.65 
 
 
271 aa  332  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  60.3 
 
 
279 aa  332  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  54.24 
 
 
280 aa  331  7.000000000000001e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  58.65 
 
 
276 aa  330  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.14 
 
 
286 aa  328  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.22 
 
 
286 aa  323  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  57.87 
 
 
271 aa  311  6.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  58.2 
 
 
270 aa  311  9e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  57.69 
 
 
284 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  58.59 
 
 
270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.09 
 
 
267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  57.66 
 
 
275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  56.69 
 
 
267 aa  305  7e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  53.28 
 
 
260 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  55.51 
 
 
268 aa  299  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.13 
 
 
271 aa  299  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  54.15 
 
 
260 aa  298  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  55.69 
 
 
272 aa  297  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  56.85 
 
 
277 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  52.81 
 
 
265 aa  295  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  53.94 
 
 
265 aa  294  9e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  53.94 
 
 
265 aa  294  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.34 
 
 
270 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  53.49 
 
 
260 aa  292  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  55.28 
 
 
270 aa  292  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.36 
 
 
266 aa  291  9e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  56.1 
 
 
260 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  56.1 
 
 
260 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  54.07 
 
 
270 aa  289  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  54.47 
 
 
270 aa  289  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  55.69 
 
 
269 aa  288  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  51.38 
 
 
285 aa  287  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  56.61 
 
 
273 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  53.63 
 
 
270 aa  286  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  54.26 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  54.26 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  54.26 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  52.34 
 
 
270 aa  279  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  53.54 
 
 
273 aa  276  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  54.33 
 
 
282 aa  275  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  52.36 
 
 
283 aa  268  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  52.36 
 
 
283 aa  268  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  52.36 
 
 
283 aa  268  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  45.9 
 
 
266 aa  221  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  44.94 
 
 
267 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  46.76 
 
 
267 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  46.76 
 
 
267 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  46.3 
 
 
267 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.07 
 
 
308 aa  102  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.23 
 
 
278 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  26.1 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.34 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  31.55 
 
 
4917 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.52 
 
 
290 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  27.57 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  27.57 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  29.33 
 
 
313 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0330  hypothetical protein  26.91 
 
 
437 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.608164 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  27.47 
 
 
324 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  26.22 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  27.95 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2836  gas vesicle protein GvpN  26.82 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  26.32 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  28.45 
 
 
301 aa  82  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  25.47 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  27.51 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  25.47 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  25.84 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>