244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0423 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  100 
 
 		 266 aa  553  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  76.98 
 
 		 267 aa  432  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  76.34 
 
 		 268 aa  424  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  72.73 
 
 		 272 aa  410  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  72.73 
 
 		 267 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  72.73 
 
 		 272 aa  410  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  71.15 
 
 		 307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  71.26 
 
 		 267 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  70.08 
 
 		 267 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  71.59 
 
 		 268 aa  403  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  70 
 
 		 278 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  70.88 
 
 		 266 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  70.34 
 
 		 267 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  70.34 
 
 		 267 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  70.83 
 
 		 265 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  68.82 
 
 		 267 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  70.38 
 
 		 271 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  68.18 
 
 		 267 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  68.18 
 
 		 267 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  69.58 
 
 		 268 aa  392  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  67.42 
 
 		 268 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  69.32 
 
 		 268 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  65.79 
 
 		 269 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  71.14 
 
 		 272 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  66.16 
 
 		 267 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  61.22 
 
 		 272 aa  355  5e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  58.33 
 
 		 285 aa  344  8e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  60.77 
 
 		 279 aa  343  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  59.92 
 
 		 266 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  56.98 
 
 		 280 aa  327  8e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  56.98 
 
 		 270 aa  328  8e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.05 
 
 		 286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.14 
 
 		 286 aa  326  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  54.44 
 
 		 265 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.47 
 
 		 271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  51.65 
 
 		 280 aa  306  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  54.51 
 
 		 279 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  55.47 
 
 		 276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  53.94 
 
 		 260 aa  302  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.14 
 
 		 271 aa  296  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  52.92 
 
 		 270 aa  296  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  52.14 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  53.49 
 
 		 275 aa  291  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  51.37 
 
 		 285 aa  289  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  57.92 
 
 		 284 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  55.08 
 
 		 270 aa  288  6e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  53.36 
 
 		 260 aa  288  9e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  54.77 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  51.57 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  54.12 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  53.33 
 
 		 271 aa  286  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.18 
 
 		 267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  52.55 
 
 		 260 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.98 
 
 		 266 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  51.94 
 
 		 282 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  51.94 
 
 		 282 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  55.23 
 
 		 260 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  51.94 
 
 		 282 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  51.57 
 
 		 273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  49.26 
 
 		 273 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  51.34 
 
 		 270 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  52.03 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  49.8 
 
 		 265 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  49.8 
 
 		 265 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.44 
 
 		 270 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  49.41 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  52.14 
 
 		 270 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  50.98 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  50.98 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  50.98 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  49.81 
 
 		 269 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  49.81 
 
 		 270 aa  273  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  51.76 
 
 		 282 aa  271  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  50.81 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  51.22 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  47.54 
 
 		 266 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  46.77 
 
 		 267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  47.13 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  47.13 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  46.72 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  27.2 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  27.2 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  27.2 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.74 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.47 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  32.78 
 
 		 4917 aa  92.4  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.07 
 
 		 290 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.36 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  29.41 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  31.66 
 
 		 4979 aa  88.2  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  29.08 
 
 		 4844 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  26.94 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.85 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0330  hypothetical protein  27.1 
 
 		 437 aa  82.4  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.608164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  26.34 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  26.34 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  26.34 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  26.34 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  26.34 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  26.34 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>