More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1498 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4008  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  56.3 
 
 		 756 aa  879    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0728152 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2124  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  41.92 
 
 		 785 aa  637    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168971  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1789  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  54.53 
 
 		 756 aa  824    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2464  ATP-dependent protease ATP-binding specificity subunit  54.18 
 
 		 762 aa  847    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0837  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  50.87 
 
 		 760 aa  778    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214089  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1169  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  46.09 
 
 		 824 aa  697    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123794  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0520  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  49.75 
 
 		 752 aa  769    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2207  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  50.43 
 
 		 783 aa  798    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.177783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1429  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  46.71 
 
 		 832 aa  740    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.143745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0349  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  46.64 
 
 		 817 aa  717    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16906  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1498  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  100 
 
 		 849 aa  1736    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000296349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2752  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  53.93 
 
 		 765 aa  854    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.929271  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3503  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  54.19 
 
 		 778 aa  838    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0375763  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2293  chaperonin clpA/B  50.75 
 
 		 771 aa  791    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2260  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  46.59 
 
 		 817 aa  704    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0841  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  50.74 
 
 		 760 aa  777    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2587  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  56.98 
 
 		 758 aa  885    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.317427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1286  ATP-dependent clp protease ATP-binding subunit  50.88 
 
 		 753 aa  778    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28270  ATP-dependent clp protease, ATP-binding subunit, ClipA  57.34 
 
 		 756 aa  902    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0789  AAA ATPase  50.62 
 
 		 760 aa  770    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1452  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpA  46.21 
 
 		 746 aa  681    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.833641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0066  ATP dependent Clp protease  49.57 
 
 		 792 aa  775    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.970057  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5345  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  46.57 
 
 		 832 aa  725    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1041  ATPase AAA-2  48.74 
 
 		 785 aa  732    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1249  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  53.24 
 
 		 757 aa  830    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37178  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0678  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  49.75 
 
 		 752 aa  769    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.244432 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2440  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  56.7 
 
 		 753 aa  893    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5002  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  49.19 
 
 		 829 aa  770    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.324843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0787  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  46.18 
 
 		 828 aa  718    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.165344 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1677  ATPase AAA-2  97.17 
 
 		 845 aa  1669    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.220039  normal  0.716629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2892  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  54.18 
 
 		 765 aa  849    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3412  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  57.18 
 
 		 756 aa  911    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.117396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0168  ATPase AAA-2  46.44 
 
 		 779 aa  707    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.152737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1117  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  48.53 
 
 		 838 aa  766    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328847  normal  0.667342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2343  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  54.3 
 
 		 762 aa  854    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332707  normal  0.192928 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1347  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  50.82 
 
 		 753 aa  775    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2733  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  54.3 
 
 		 762 aa  854    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354308  normal  0.381492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1667  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  46.24 
 
 		 829 aa  695    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.134517  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1126  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  45.97 
 
 		 824 aa  693    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.359494  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3260  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  54.3 
 
 		 751 aa  833    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.625652  hitchhiker  0.000000000240125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30230  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  56.98 
 
 		 758 aa  885    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0385  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  45.42 
 
 		 734 aa  675    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1825  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  57.41 
 
 		 756 aa  912    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620504 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1934  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  53.23 
 
 		 778 aa  846    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0580  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  44.32 
 
 		 788 aa  647    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0126  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  49.26 
 
 		 771 aa  786    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1591  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  77.29 
 
 		 854 aa  1305    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0126438  hitchhiker  0.0000548277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3613  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  57.53 
 
 		 756 aa  914    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0572282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2021  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  46.34 
 
 		 824 aa  698    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0655166  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0968  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  50.75 
 
 		 771 aa  791    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0835  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  47.93 
 
 		 763 aa  687    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  41.51 
 
 		 822 aa  597  1e-169  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  40.32 
 
 		 854 aa  592  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2617  ATPase AAA-2 domain protein  40.14 
 
 		 846 aa  587  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  40.68 
 
 		 835 aa  587  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  41.44 
 
 		 836 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0024  ATPase  42.55 
 
 		 818 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000951044  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  41.18 
 
 		 830 aa  580  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  40.49 
 
 		 848 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0363  ATPase  41.31 
 
 		 830 aa  580  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0571642  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  40.68 
 
 		 834 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  40.77 
 
 		 847 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  41.01 
 
 		 837 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  41.21 
 
 		 839 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0255  ATPase AAA-2 domain protein  40.6 
 
 		 849 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6630  ATPase AAA-2 domain protein  40.25 
 
 		 844 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1079  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  40.29 
 
 		 848 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  41.16 
 
 		 830 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  40.07 
 
 		 854 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  40.17 
 
 		 861 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  41.01 
 
 		 852 aa  570  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  40.29 
 
 		 829 aa  571  1e-161  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  39.93 
 
 		 855 aa  569  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  39.66 
 
 		 840 aa  569  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  39.71 
 
 		 852 aa  569  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 866 aa  570  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1370  ATPase AAA-2 domain protein  41.06 
 
 		 843 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  40.14 
 
 		 812 aa  570  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  41.15 
 
 		 792 aa  568  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  41.04 
 
 		 830 aa  567  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1902  ATPase  38.98 
 
 		 879 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  39.76 
 
 		 841 aa  568  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0726  ATPase  41.75 
 
 		 820 aa  568  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  40.65 
 
 		 792 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0617  chaperone protein clpB  39.35 
 
 		 871 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.995797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  40.47 
 
 		 846 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1132  ATPase AAA-2 domain protein  40.17 
 
 		 846 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.502514  normal  0.57149 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0750  ATPase  41.57 
 
 		 820 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0092536  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  40.52 
 
 		 869 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0355  ATPase AAA-2 domain protein  41.13 
 
 		 853 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000716084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  40.43 
 
 		 844 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  39.26 
 
 		 857 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0330  ATPase AAA-2 domain protein  40.09 
 
 		 849 aa  561  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.711717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2746  protein disaggregation chaperone  39.26 
 
 		 857 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00462147  normal  0.181562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  40.48 
 
 		 823 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  40.55 
 
 		 814 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02446  hypothetical protein  39.26 
 
 		 857 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000202693  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  40.44 
 
 		 836 aa  561  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1436  ATPase AAA-2 domain protein  39.73 
 
 		 834 aa  561  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.327817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  40.43 
 
 		 844 aa  559  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>