More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2124 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2606  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  43.32 
 
 		 758 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2760  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  43.36 
 
 		 758 aa  643    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00164003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4008  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  44.43 
 
 		 756 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0728152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2472  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  44.34 
 
 		 755 aa  658    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000013712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2227  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  44.34 
 
 		 755 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0179125  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2124  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  100 
 
 		 785 aa  1595    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1825  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  44.3 
 
 		 756 aa  651    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620504 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1789  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  46.23 
 
 		 756 aa  696    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2587  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  44.76 
 
 		 758 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.317427  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2464  ATP-dependent protease ATP-binding specificity subunit  43.4 
 
 		 762 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2893  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  44.65 
 
 		 752 aa  663    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243506  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1591  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  41.92 
 
 		 854 aa  645    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0126438  hitchhiker  0.0000548277 
 
 
-
 
NC_004310  BR1169  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  43.8 
 
 		 824 aa  674    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123794  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2626  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  44.62 
 
 		 755 aa  661    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3353  ATP-dependent clp protease, ATP-binding subunit ClpA  44.82 
 
 		 757 aa  661    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.427297  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2281  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  44.68 
 
 		 766 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00581286  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0880  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  43.57 
 
 		 755 aa  648    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0851  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  43.32 
 
 		 755 aa  646    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3183  putative AAA ATPase  44.95 
 
 		 757 aa  661    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.120903 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0955  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  43.36 
 
 		 758 aa  643    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000349844  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3095  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  43.74 
 
 		 753 aa  652    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.840069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1748  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  43.66 
 
 		 768 aa  644    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2752  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  44.01 
 
 		 765 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.929271  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2465  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  44.47 
 
 		 755 aa  662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000928581  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1237  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  43.4 
 
 		 750 aa  647    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1695  AAA ATPase  43.71 
 
 		 801 aa  677    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.408857 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0126  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  43.42 
 
 		 771 aa  657    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1114  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpA  44.68 
 
 		 884 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000182282  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2425  ATP-dependent Clp protease  45.12 
 
 		 754 aa  665    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3590  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  45.09 
 
 		 756 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2293  chaperonin clpA/B  43.67 
 
 		 771 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2260  ATP-binding component of serine protease  45.76 
 
 		 752 aa  688    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5850  AAA ATPase, Clp  44.46 
 
 		 766 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00186386  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1566  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  44.6 
 
 		 752 aa  672    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.121639  normal  0.660499 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2099  ATPase  45.47 
 
 		 760 aa  707    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0835  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  45.69 
 
 		 763 aa  667    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2481  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  45.37 
 
 		 751 aa  677    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01567  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  43.46 
 
 		 756 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2109  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  43.71 
 
 		 779 aa  658    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0968  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  43.67 
 
 		 771 aa  654    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0763  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  44.28 
 
 		 766 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000501038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0789  AAA ATPase  46.37 
 
 		 760 aa  681    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2207  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  43.65 
 
 		 783 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.177783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2396  AAA_5 ATPase  43.68 
 
 		 801 aa  675    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.666278 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0066  ATP dependent Clp protease  45.23 
 
 		 792 aa  694    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.970057  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2021  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  43.84 
 
 		 824 aa  673    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0655166  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1041  ATPase AAA-2  42.48 
 
 		 785 aa  637    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1286  ATP-dependent clp protease ATP-binding subunit  43.67 
 
 		 753 aa  652    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1687  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  43.5 
 
 		 761 aa  677    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000140768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3324  ATPase AAA-2  43.16 
 
 		 802 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.660332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0508  ATPase AAA-2  44.47 
 
 		 763 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1674  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  42.89 
 
 		 759 aa  638    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.521832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0801  putative ATP-dependent Clp protease ATP- binding subunit  44.88 
 
 		 765 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00134751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1834  ATPase AAA-2  44.61 
 
 		 753 aa  644    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00123465  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3055  ATPase AAA-2  43.55 
 
 		 801 aa  670    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2440  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  43.2 
 
 		 753 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2416  ATPase AAA-2  42.86 
 
 		 799 aa  665    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164415  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2532  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  44.21 
 
 		 752 aa  662    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000101202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2892  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  43.4 
 
 		 765 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2393  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  45.07 
 
 		 756 aa  663    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0793995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2798  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  43.32 
 
 		 794 aa  672    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2092  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpA  42.64 
 
 		 792 aa  651    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0168  ATPase AAA-2  44.21 
 
 		 779 aa  665    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.152737 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1907  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpA  44.73 
 
 		 766 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298662  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0714  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  43.68 
 
 		 756 aa  646    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1117  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  43.54 
 
 		 838 aa  656    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328847  normal  0.667342 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2374  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  42.88 
 
 		 755 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00226066  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1373  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  43.47 
 
 		 819 aa  672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1217  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  47.04 
 
 		 776 aa  707    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1886  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  43.43 
 
 		 752 aa  657    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00020211  hitchhiker  0.00000193236 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1053  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  44.68 
 
 		 766 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00191879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1648  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  45.29 
 
 		 755 aa  674    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1723  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  45.15 
 
 		 755 aa  672    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000145308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1447  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  44.81 
 
 		 756 aa  667    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.721144  normal  0.19219 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2254  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  43.82 
 
 		 752 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00769581  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1286  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  45.03 
 
 		 770 aa  670    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.641914 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2566  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  44.2 
 
 		 766 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0752747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30230  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  44.76 
 
 		 758 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2158  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  44.68 
 
 		 766 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0275197  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1399  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  43.54 
 
 		 759 aa  636    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.103795 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2518  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  44.46 
 
 		 766 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0417713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0043  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  46.52 
 
 		 776 aa  681    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00409723  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4536  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  42.39 
 
 		 823 aa  665    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.783313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1753  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  45.15 
 
 		 755 aa  671    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2546  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  43.86 
 
 		 775 aa  668    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1126  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  43.67 
 
 		 824 aa  670    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.359494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0964  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  44.68 
 
 		 766 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.607377  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3812  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  43.13 
 
 		 772 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356989  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0960  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  44.68 
 
 		 766 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000364582  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2056  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  44.39 
 
 		 753 aa  662    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.196672  normal  0.465232 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0743  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  43.78 
 
 		 752 aa  639    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1532  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  45.56 
 
 		 776 aa  684    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.846759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3238  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  44.56 
 
 		 783 aa  641    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49945 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1832  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  45.14 
 
 		 782 aa  643    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724009  normal  0.325801 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0986  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  43.36 
 
 		 758 aa  643    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0576  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  44.68 
 
 		 766 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000033663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4482  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  44.75 
 
 		 783 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4772  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  42.89 
 
 		 796 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1400  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  44.06 
 
 		 756 aa  679    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2461  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  44.49 
 
 		 774 aa  647    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.597625  normal  0.840224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>