More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1677 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1769  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  48.11 
 
 		 830 aa  767    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0732353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4008  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  55.14 
 
 		 756 aa  851    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0728152 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2124  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  41.47 
 
 		 785 aa  636    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168971  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2464  ATP-dependent protease ATP-binding specificity subunit  53.78 
 
 		 762 aa  848    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1169  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  48.9 
 
 		 824 aa  775    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123794  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1452  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpA  46.58 
 
 		 746 aa  686    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.833641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2207  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  50.19 
 
 		 783 aa  795    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.177783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2587  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  57.35 
 
 		 758 aa  895    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.317427  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1498  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  97.17 
 
 		 849 aa  1669    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000296349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2752  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  53.98 
 
 		 765 aa  858    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.929271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0837  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  50.37 
 
 		 760 aa  764    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214089  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0385  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  46.05 
 
 		 734 aa  677    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2293  chaperonin clpA/B  50.5 
 
 		 771 aa  788    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1347  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  50.44 
 
 		 753 aa  770    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1626  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  44.31 
 
 		 732 aa  660    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2393  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  57.05 
 
 		 756 aa  890    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0793995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0349  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  46.4 
 
 		 817 aa  718    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16906  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1126  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  48.78 
 
 		 824 aa  770    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.359494  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0789  AAA ATPase  50.25 
 
 		 760 aa  757    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2651  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  51.56 
 
 		 773 aa  804    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2940  ATPase AAA-2  52.01 
 
 		 778 aa  814    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206426  normal  0.985404 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1591  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  77.52 
 
 		 854 aa  1313    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0126438  hitchhiker  0.0000548277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2416  ATPase AAA-2  47.4 
 
 		 799 aa  745    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164415  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2021  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  45.14 
 
 		 824 aa  701    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0655166  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1677  ATPase AAA-2  100 
 
 		 845 aa  1731    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.220039  normal  0.716629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2892  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  54.18 
 
 		 765 aa  852    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2733  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  53.84 
 
 		 762 aa  857    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354308  normal  0.381492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0168  ATPase AAA-2  47.45 
 
 		 779 aa  736    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.152737 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1429  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  46.22 
 
 		 832 aa  737    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.143745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1572  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  48.28 
 
 		 830 aa  768    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0355023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3503  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  54.32 
 
 		 778 aa  842    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0375763  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1117  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  48.53 
 
 		 838 aa  767    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328847  normal  0.667342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5002  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  49.07 
 
 		 829 aa  775    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.324843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30230  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  57.35 
 
 		 758 aa  895    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0841  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  50.25 
 
 		 760 aa  762    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3812  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  49.81 
 
 		 772 aa  773    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356989  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0743  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  50.92 
 
 		 752 aa  801    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1532  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  45.45 
 
 		 776 aa  685    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.846759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1934  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  52.12 
 
 		 778 aa  818    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0580  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  43.65 
 
 		 788 aa  665    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1286  ATP-dependent clp protease ATP-binding subunit  50.5 
 
 		 753 aa  773    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2260  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  46.22 
 
 		 817 aa  704    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108561 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2461  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  52.86 
 
 		 774 aa  848    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.597625  normal  0.840224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2343  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  53.84 
 
 		 762 aa  857    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332707  normal  0.192928 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0968  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  50.5 
 
 		 771 aa  788    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1825  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  55.27 
 
 		 756 aa  851    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0126  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  49.75 
 
 		 771 aa  798    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  41.78 
 
 		 822 aa  602  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2617  ATPase AAA-2 domain protein  41.01 
 
 		 846 aa  591  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  41.17 
 
 		 854 aa  588  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1237  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  41.85 
 
 		 768 aa  587  1e-166  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0024  ATPase  42.42 
 
 		 818 aa  587  1e-166  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000951044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  40.26 
 
 		 835 aa  579  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  40.75 
 
 		 847 aa  579  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6630  ATPase AAA-2 domain protein  40.74 
 
 		 844 aa  580  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  40.3 
 
 		 848 aa  579  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0363  ATPase  41.43 
 
 		 830 aa  581  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0571642  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  39.19 
 
 		 871 aa  579  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  41.28 
 
 		 837 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  40.9 
 
 		 836 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0255  ATPase AAA-2 domain protein  41.08 
 
 		 849 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1079  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  40.17 
 
 		 848 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1902  ATPase  39.56 
 
 		 879 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  40.97 
 
 		 839 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  40.64 
 
 		 861 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  40.69 
 
 		 830 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  39.77 
 
 		 873 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0617  chaperone protein clpB  40.09 
 
 		 871 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.995797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  40.71 
 
 		 834 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  40.91 
 
 		 830 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  40.48 
 
 		 812 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1370  ATPase AAA-2 domain protein  41.06 
 
 		 843 aa  571  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  40.27 
 
 		 829 aa  569  1e-161  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  39.78 
 
 		 854 aa  570  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  39.84 
 
 		 857 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  39.84 
 
 		 857 aa  566  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3833  protein disaggregation chaperone  39.84 
 
 		 857 aa  566  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000168048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02446  hypothetical protein  39.84 
 
 		 857 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000202693  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  40.58 
 
 		 823 aa  566  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  39.35 
 
 		 852 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2750  protein disaggregation chaperone  39.84 
 
 		 857 aa  566  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917665  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0726  ATPase  41.75 
 
 		 820 aa  567  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2878  protein disaggregation chaperone  39.84 
 
 		 857 aa  566  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000852772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  39.93 
 
 		 855 aa  567  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  38.7 
 
 		 871 aa  566  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  40.8 
 
 		 866 aa  568  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1089  protein disaggregation chaperone  39.84 
 
 		 857 aa  566  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000860565  decreased coverage  0.000000635783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  40.17 
 
 		 841 aa  567  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2746  protein disaggregation chaperone  39.84 
 
 		 857 aa  566  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00462147  normal  0.181562 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2973  protein disaggregation chaperone  39.84 
 
 		 857 aa  566  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000839096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1436  ATPase AAA-2 domain protein  39.7 
 
 		 834 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.327817 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  39.9 
 
 		 824 aa  564  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  40.67 
 
 		 814 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  41.28 
 
 		 792 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  39.36 
 
 		 840 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1004  protein disaggregation chaperone  38.64 
 
 		 857 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329839  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  41.66 
 
 		 792 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  40.62 
 
 		 852 aa  565  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  42.07 
 
 		 813 aa  563  1.0000000000000001e-159  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0750  ATPase  41.9 
 
 		 820 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0092536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>