72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1001 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  100 
 
 		 474 aa  968    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  89.47 
 
 		 475 aa  878    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1023  ATPase  55.84 
 
 		 599 aa  224  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  52.11 
 
 		 589 aa  219  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  32.14 
 
 		 803 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.17 
 
 		 748 aa  92.8  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.9 
 
 		 651 aa  93.2  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.67 
 
 		 530 aa  72  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1943  ATPase  36.76 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.587571  hitchhiker  0.00000000309284 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.62 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.06 
 
 		 606 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.98 
 
 		 683 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.61 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  29.78 
 
 		 609 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  29.78 
 
 		 609 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  29.61 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  29.61 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  34.25 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  30.73 
 
 		 853 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.92 
 
 		 819 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.192333 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  31.58 
 
 		 524 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.86 
 
 		 626 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  29.35 
 
 		 698 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  24.9 
 
 		 539 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  27.48 
 
 		 899 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  30.21 
 
 		 629 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.32 
 
 		 502 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  29.57 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  28.14 
 
 		 743 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.21 
 
 		 729 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  28.99 
 
 		 805 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.14 
 
 		 743 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  26.62 
 
 		 587 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.15 
 
 		 754 aa  51.6  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.42 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  29.21 
 
 		 781 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  25.81 
 
 		 822 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  35.96 
 
 		 264 aa  49.7  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.58 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.15 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  35.34 
 
 		 603 aa  47.8  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  27.47 
 
 		 810 aa  47  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.81 
 
 		 530 aa  46.6  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  26.22 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.49 
 
 		 568 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17401  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.21 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.44 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.829729  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  26.92 
 
 		 655 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2074  ATPase  32.85 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  32.76 
 
 		 598 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.38 
 
 		 732 aa  45.8  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  25.51 
 
 		 734 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.8 
 
 		 585 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  24.06 
 
 		 335 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  25.2 
 
 		 337 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0910  ATPase  32 
 
 		 314 aa  44.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  26.37 
 
 		 668 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1504  ATPase  27.22 
 
 		 716 aa  44.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.369638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  26.64 
 
 		 678 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  35.19 
 
 		 662 aa  44.7  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  26.09 
 
 		 571 aa  44.3  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  26.47 
 
 		 741 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2505  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.89 
 
 		 315 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  26.89 
 
 		 370 aa  43.5  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  27.37 
 
 		 653 aa  43.5  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.34 
 
 		 398 aa  43.5  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.4 
 
 		 362 aa  43.5  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  29.37 
 
 		 412 aa  43.5  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  29.91 
 
 		 371 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  28.37 
 
 		 705 aa  43.5  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  36.27 
 
 		 517 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0330  hypothetical protein  33.93 
 
 		 437 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.608164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>