89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4510 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 530 aa  1090    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  47.71 
 
 		 851 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  41.76 
 
 		 678 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  39.5 
 
 		 587 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  59.12 
 
 		 834 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  46.53 
 
 		 845 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.23 
 
 		 685 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.19 
 
 		 765 aa  211  3e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  53.85 
 
 		 662 aa  206  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  42.38 
 
 		 691 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  39.94 
 
 		 685 aa  203  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  53.11 
 
 		 603 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  41.33 
 
 		 705 aa  196  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.33 
 
 		 723 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.45 
 
 		 683 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  44.11 
 
 		 999 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  46.64 
 
 		 862 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  50.5 
 
 		 696 aa  187  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  54.49 
 
 		 517 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  55.49 
 
 		 517 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  49.21 
 
 		 687 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  52.05 
 
 		 900 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  48.08 
 
 		 722 aa  177  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  38.13 
 
 		 822 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.11 
 
 		 754 aa  174  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  37.41 
 
 		 605 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  33.75 
 
 		 666 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  32.63 
 
 		 700 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  39.61 
 
 		 498 aa  164  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  43.85 
 
 		 598 aa  163  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  38.85 
 
 		 498 aa  159  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.74 
 
 		 626 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  36.17 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  35.53 
 
 		 459 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  35.53 
 
 		 459 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  36.3 
 
 		 743 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.87 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.52 
 
 		 743 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  36.53 
 
 		 698 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  37.02 
 
 		 853 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  35.87 
 
 		 539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.77 
 
 		 732 aa  141  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.76 
 
 		 568 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.52 
 
 		 590 aa  139  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  32.26 
 
 		 638 aa  139  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.96 
 
 		 502 aa  139  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.03 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  34.25 
 
 		 629 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  37.5 
 
 		 899 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  35.08 
 
 		 810 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  37.28 
 
 		 734 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  34.98 
 
 		 781 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.34 
 
 		 729 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  34.77 
 
 		 609 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  34.77 
 
 		 609 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  31.27 
 
 		 805 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.61 
 
 		 398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  39.9 
 
 		 655 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  31.97 
 
 		 352 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  33.09 
 
 		 741 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  39.2 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  28.21 
 
 		 412 aa  95.9  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  28.75 
 
 		 303 aa  94.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.67 
 
 		 585 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.36 
 
 		 449 aa  92  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  28.41 
 
 		 513 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  30.99 
 
 		 513 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  28.26 
 
 		 450 aa  86.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  24.89 
 
 		 653 aa  84.3  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.56 
 
 		 510 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.31 
 
 		 410 aa  73.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40 
 
 		 795 aa  71.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.99 
 
 		 603 aa  68.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  22.11 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1597  ATPase  23.78 
 
 		 714 aa  60.5  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0251124  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0700  ATPase  23.78 
 
 		 714 aa  60.5  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.44 
 
 		 748 aa  57.4  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.24 
 
 		 651 aa  54.7  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  24.9 
 
 		 668 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  30.05 
 
 		 524 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1956  ATPase  25 
 
 		 938 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  28.99 
 
 		 475 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  37.63 
 
 		 523 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1943  ATPase  26.32 
 
 		 403 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.587571  hitchhiker  0.00000000309284 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  23.44 
 
 		 803 aa  47.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  29.81 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9309  predicted protein  31.32 
 
 		 284 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00065692  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.45 
 
 		 530 aa  45.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  25.73 
 
 		 589 aa  44.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>