89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3183 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 606 aa  1229    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.11 
 
 		 530 aa  128  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  30.47 
 
 		 803 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.38 
 
 		 748 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.27 
 
 		 651 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.03 
 
 		 819 aa  88.2  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.192333 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.29 
 
 		 410 aa  76.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1023  ATPase  28.88 
 
 		 599 aa  70.5  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  26.7 
 
 		 853 aa  70.5  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  26.67 
 
 		 589 aa  69.3  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.02 
 
 		 568 aa  68.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  29.7 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  24.81 
 
 		 609 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  24.81 
 
 		 609 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 		 626 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.7 
 
 		 729 aa  65.1  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  28.79 
 
 		 743 aa  64.3  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  29.96 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  29.61 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.29 
 
 		 743 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  25.14 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  28.43 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  28.64 
 
 		 524 aa  60.5  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.82 
 
 		 421 aa  60.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  26.09 
 
 		 734 aa  58.9  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  26.12 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  24.26 
 
 		 698 aa  57.4  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  25.59 
 
 		 678 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.81 
 
 		 378 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  25.38 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.38 
 
 		 465 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  25.38 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  24.55 
 
 		 805 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1943  ATPase  27.15 
 
 		 403 aa  55.5  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.587571  hitchhiker  0.00000000309284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  27.09 
 
 		 741 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.42 
 
 		 364 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.56 
 
 		 683 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  25.64 
 
 		 668 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  26.92 
 
 		 781 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  23.97 
 
 		 364 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.17 
 
 		 297 aa  52.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.53 
 
 		 379 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  27.68 
 
 		 629 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  26.61 
 
 		 355 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  25.67 
 
 		 899 aa  51.6  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.05 
 
 		 585 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1956  ATPase  24.04 
 
 		 938 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  24.73 
 
 		 810 aa  50.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  28.96 
 
 		 378 aa  50.8  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  23.23 
 
 		 587 aa  50.8  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  24.16 
 
 		 822 aa  50.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.83 
 
 		 603 aa  50.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.71 
 
 		 366 aa  50.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.5 
 
 		 371 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  25.11 
 
 		 364 aa  50.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.88 
 
 		 356 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  26.12 
 
 		 359 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  25.91 
 
 		 360 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  21.88 
 
 		 590 aa  48.5  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  24.16 
 
 		 655 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.96 
 
 		 732 aa  48.5  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  28.65 
 
 		 369 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  28.49 
 
 		 370 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  23.81 
 
 		 450 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  28.49 
 
 		 370 aa  48.5  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  24.24 
 
 		 638 aa  47.8  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  24.68 
 
 		 365 aa  47.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.11 
 
 		 362 aa  47.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  24.37 
 
 		 304 aa  47.4  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.85 
 
 		 363 aa  47.4  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  31.82 
 
 		 318 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  27.01 
 
 		 372 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  32.97 
 
 		 334 aa  46.2  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.08 
 
 		 324 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  26.9 
 
 		 363 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.14 
 
 		 365 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  28.91 
 
 		 339 aa  46.2  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.56 
 
 		 510 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  30.64 
 
 		 306 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.15 
 
 		 380 aa  45.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  30.28 
 
 		 332 aa  45.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  24.18 
 
 		 700 aa  44.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  30.77 
 
 		 572 aa  44.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  28.02 
 
 		 371 aa  43.9  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.23 
 
 		 363 aa  43.9  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  25.31 
 
 		 4979 aa  43.9  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  23.91 
 
 		 307 aa  43.9  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.02 
 
 		 381 aa  43.9  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>