211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4846 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4846  ATPase  100 
 
 		 360 aa  729    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  78.03 
 
 		 364 aa  586  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  80.9 
 
 		 365 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  74.58 
 
 		 359 aa  570  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  73.24 
 
 		 379 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  72.39 
 
 		 378 aa  544  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  69.75 
 
 		 364 aa  532  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.79 
 
 		 358 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.89 
 
 		 364 aa  521  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  68.72 
 
 		 355 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.12 
 
 		 366 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  67.79 
 
 		 361 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  69.69 
 
 		 366 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.88 
 
 		 363 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.41 
 
 		 366 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.27 
 
 		 366 aa  512  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.14 
 
 		 362 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  72.39 
 
 		 380 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.75 
 
 		 371 aa  497  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  69.21 
 
 		 395 aa  491  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.98 
 
 		 361 aa  413  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.11 
 
 		 369 aa  291  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  43.21 
 
 		 371 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.84 
 
 		 373 aa  278  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  42.9 
 
 		 370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  44.78 
 
 		 363 aa  272  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  41.35 
 
 		 370 aa  272  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  41.5 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  44.81 
 
 		 378 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.09 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.74 
 
 		 365 aa  255  8e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.94 
 
 		 363 aa  248  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  41.71 
 
 		 391 aa  245  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  43.89 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.51 
 
 		 385 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  39.32 
 
 		 362 aa  237  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  39.03 
 
 		 362 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  39.03 
 
 		 362 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  39.03 
 
 		 362 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  39.03 
 
 		 362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  39.03 
 
 		 362 aa  236  7e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  38.75 
 
 		 362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.75 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  38.96 
 
 		 376 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  40.49 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.19 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.71 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  33.54 
 
 		 620 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.7 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  29.95 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  30.1 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  27.51 
 
 		 306 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  27.2 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.03 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.33 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.68 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  28.71 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.58 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.88 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.47 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  29 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  31.12 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  28 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.77 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.77 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.18 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  29.58 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  28.67 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  29.05 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  26.99 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.61 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  30.21 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  26.79 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.51 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  25.65 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.71 
 
 		 297 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  27.19 
 
 		 312 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  26 
 
 		 326 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  27.47 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.72 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.24 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  25.5 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  27.27 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1615  ATPase  24.47 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.78 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0783  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.1 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.12 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  28.16 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.9 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  28.85 
 
 		 291 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  26.12 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.18 
 
 		 291 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.65 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  27.8 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.95 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  29.37 
 
 		 263 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  29.37 
 
 		 263 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  29.56 
 
 		 302 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.05 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.97 
 
 		 300 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>