149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2864 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 568 aa  1127    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  43.01 
 
 		 698 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  43.92 
 
 		 629 aa  198  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  42.75 
 
 		 853 aa  194  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  41.05 
 
 		 743 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.9 
 
 		 502 aa  183  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  42.02 
 
 		 539 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.89 
 
 		 743 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  42.16 
 
 		 678 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.96 
 
 		 729 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  36.3 
 
 		 700 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.46 
 
 		 626 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  41.54 
 
 		 741 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  43.08 
 
 		 810 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  40.73 
 
 		 899 aa  170  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.35 
 
 		 685 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  38.46 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  40.76 
 
 		 691 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  38.46 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.08 
 
 		 465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  40.77 
 
 		 685 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.2 
 
 		 421 aa  160  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  37.16 
 
 		 822 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38 
 
 		 732 aa  156  9e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  38.46 
 
 		 805 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.72 
 
 		 754 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.77 
 
 		 683 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  35.49 
 
 		 666 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  32 
 
 		 705 aa  154  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.76 
 
 		 765 aa  154  5.9999999999999996e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  41.42 
 
 		 734 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  49.71 
 
 		 655 aa  153  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  42.02 
 
 		 609 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  42.02 
 
 		 609 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  40.67 
 
 		 781 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  37.04 
 
 		 587 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  31.95 
 
 		 638 aa  143  7e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.76 
 
 		 530 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.18 
 
 		 590 aa  140  6e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  34.9 
 
 		 303 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  36.54 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.88 
 
 		 585 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  38.15 
 
 		 412 aa  120  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  33.84 
 
 		 999 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  32.6 
 
 		 498 aa  117  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  36.36 
 
 		 450 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  42.07 
 
 		 687 aa  117  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  31.6 
 
 		 498 aa  114  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  40.62 
 
 		 517 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  40.74 
 
 		 517 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  29.89 
 
 		 851 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  35.83 
 
 		 845 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.94 
 
 		 723 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  42.94 
 
 		 900 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  41.25 
 
 		 862 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.51 
 
 		 398 aa  105  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  40.24 
 
 		 834 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  40.37 
 
 		 696 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  36.25 
 
 		 662 aa  102  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  31.9 
 
 		 653 aa  101  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  36.25 
 
 		 603 aa  100  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  42.5 
 
 		 722 aa  99  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.85 
 
 		 795 aa  99  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  28.83 
 
 		 352 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  33.51 
 
 		 571 aa  90.5  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  40.3 
 
 		 605 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  29.21 
 
 		 513 aa  87  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  36.92 
 
 		 598 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  28.64 
 
 		 513 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.4 
 
 		 603 aa  82.4  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  25.82 
 
 		 597 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.29 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.4 
 
 		 510 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.89 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.02 
 
 		 606 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  30.05 
 
 		 803 aa  67.8  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  30.06 
 
 		 578 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.64 
 
 		 748 aa  63.9  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.71 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.75 
 
 		 578 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207513 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.92 
 
 		 651 aa  56.6  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  24.18 
 
 		 792 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.08 
 
 		 559 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  25.34 
 
 		 844 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0121  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.46 
 
 		 315 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  hitchhiker  0.00112099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  26.71 
 
 		 847 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  26.71 
 
 		 843 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  30.53 
 
 		 524 aa  54.3  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  24.85 
 
 		 679 aa  53.9  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.03 
 
 		 559 aa  53.5  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0046  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.39 
 
 		 568 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0896  ATPase  26.83 
 
 		 549 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.814687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  24.66 
 
 		 844 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1956  ATPase  25.69 
 
 		 938 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.14 
 
 		 668 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0700  ATPase  27.43 
 
 		 714 aa  51.6  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1597  ATPase  27.43 
 
 		 714 aa  51.6  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0251124  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.69 
 
 		 319 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0021  hypothetical protein  25.93 
 
 		 735 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.097053  normal  0.930139 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>