90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0880 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  100 
 
 
638 aa  1276    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.71 
 
 
590 aa  234  3e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.3 
 
 
683 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.21 
 
 
732 aa  152  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  32.32 
 
 
741 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.241934 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  34.15 
 
 
459 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  34.15 
 
 
459 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.19 
 
 
465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.62 
 
 
626 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.13 
 
 
502 aa  144  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.83 
 
 
729 aa  141  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  30.61 
 
 
743 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.26 
 
 
530 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.16 
 
 
421 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  30.5 
 
 
899 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.58 
 
 
568 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  33.22 
 
 
705 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  33.21 
 
 
805 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  32.69 
 
 
629 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  30.16 
 
 
822 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  31.21 
 
 
609 aa  133  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  31.8 
 
 
734 aa  133  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  31.21 
 
 
609 aa  133  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.01 
 
 
743 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  32.88 
 
 
539 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  32.87 
 
 
853 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  29.51 
 
 
781 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  29.84 
 
 
700 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.65 
 
 
765 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.97 
 
 
754 aa  127  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.17 
 
 
603 aa  127  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  30.43 
 
 
587 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  28.71 
 
 
698 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  33.33 
 
 
851 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  31.87 
 
 
999 aa  120  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  28.99 
 
 
810 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  36.55 
 
 
655 aa  114  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  30.62 
 
 
691 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  28.88 
 
 
678 aa  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.66 
 
 
585 aa  108  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  31.68 
 
 
481 aa  106  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  28.68 
 
 
685 aa  106  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.43 
 
 
685 aa  104  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  36.9 
 
 
603 aa  101  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  36.36 
 
 
662 aa  98.6  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  26.6 
 
 
303 aa  98.6  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  31.19 
 
 
862 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  24.6 
 
 
666 aa  94.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  34.71 
 
 
845 aa  92.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  32.28 
 
 
696 aa  92.8  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.23 
 
 
510 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  30.68 
 
 
687 aa  92  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  28.64 
 
 
498 aa  92  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  29.63 
 
 
498 aa  91.3  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  32.46 
 
 
722 aa  89.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  31.64 
 
 
517 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  31.74 
 
 
517 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  27.05 
 
 
597 aa  87  9e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  31.01 
 
 
900 aa  87  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  27.46 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  24.34 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  33.33 
 
 
605 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  35.37 
 
 
598 aa  83.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.7 
 
 
723 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.77 
 
 
795 aa  80.9  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  32.81 
 
 
571 aa  80.5  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  31.52 
 
 
834 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  26.19 
 
 
653 aa  76.3  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.97 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  24.35 
 
 
513 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  22.99 
 
 
513 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  25.47 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.6 
 
 
449 aa  59.3  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0700  ATPase  27.74 
 
 
714 aa  55.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1597  ATPase  27.74 
 
 
714 aa  55.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0251124  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.45 
 
 
748 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.46 
 
 
410 aa  50.8  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.24 
 
 
606 aa  47.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  28.09 
 
 
844 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.57 
 
 
559 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.11 
 
 
651 aa  45.8  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.53 
 
 
668 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  25.93 
 
 
1284 aa  45.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  27.12 
 
 
844 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  27.68 
 
 
847 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  27.68 
 
 
843 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  25.27 
 
 
583 aa  44.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.44 
 
 
559 aa  44.3  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  26.27 
 
 
1041 aa  43.9  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  26.84 
 
 
792 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>