141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1397 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  100 
 
 		 369 aa  731    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  74.86 
 
 		 363 aa  541  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  68.75 
 
 		 378 aa  484  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.59 
 
 		 381 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  66.85 
 
 		 376 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.2 
 
 		 363 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  64.12 
 
 		 362 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  64.12 
 
 		 362 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  64.12 
 
 		 362 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  64.12 
 
 		 362 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  64.12 
 
 		 362 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  63.84 
 
 		 362 aa  441  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  63.84 
 
 		 362 aa  443  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  63.84 
 
 		 362 aa  444  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.38 
 
 		 385 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.84 
 
 		 373 aa  332  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  53.03 
 
 		 391 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.11 
 
 		 369 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.71 
 
 		 365 aa  319  5e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  51.51 
 
 		 300 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  47.09 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.09 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.09 
 
 		 366 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  48.32 
 
 		 364 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.47 
 
 		 366 aa  266  5.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  48.16 
 
 		 361 aa  265  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.56 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.2 
 
 		 378 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  42.18 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  47.88 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.07 
 
 		 361 aa  262  6e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  41.53 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  47.35 
 
 		 359 aa  259  8e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  40.68 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.22 
 
 		 379 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  40.4 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.25 
 
 		 371 aa  252  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  45.13 
 
 		 364 aa  249  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.2 
 
 		 380 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  43.89 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  45.25 
 
 		 365 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.73 
 
 		 358 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  47.92 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.13 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.07 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.72 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.1 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  33.79 
 
 		 620 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.12 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  28.22 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.14 
 
 		 305 aa  53.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3031  gas vesicle protein GvpN  28.19 
 
 		 307 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.08 
 
 		 295 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.86 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.86 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.13 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  30.73 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  30 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  30.41 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  28.66 
 
 		 853 aa  50.4  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  29.38 
 
 		 309 aa  50.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  26.15 
 
 		 300 aa  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  29.89 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1945  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.42736  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  29.79 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  28.96 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.95 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.65 
 
 		 606 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  26.87 
 
 		 4979 aa  47.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  27.57 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2836  gas vesicle protein GvpN  24.46 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  29.95 
 
 		 300 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  26.22 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  26.22 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  28.57 
 
 		 291 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  26.59 
 
 		 294 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0683  ATPase  24.87 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.128689  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0899  ATPase  26.43 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  27.13 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  27.5 
 
 		 810 aa  46.6  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  27.09 
 
 		 334 aa  46.6  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  25.61 
 
 		 297 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.59 
 
 		 302 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  30.81 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.23 
 
 		 729 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.26 
 
 		 403 aa  46.2  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  25.61 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  25.61 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  25.61 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  29.88 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  29.41 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  25.61 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  30.56 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  28.52 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2329  gas vesicle protein GvpN  23.41 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.52 
 
 		 295 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  29.9 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1795  ATPase  27.56 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  25.61 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  25.61 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>