100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2840 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  100 
 
 		 741 aa  1464    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  45.21 
 
 		 698 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.68 
 
 		 729 aa  411  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  39.58 
 
 		 853 aa  375  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.62 
 
 		 626 aa  355  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.65 
 
 		 743 aa  299  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  36.62 
 
 		 743 aa  282  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  35.52 
 
 		 899 aa  249  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.86 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  44.49 
 
 		 629 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.18 
 
 		 683 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  36.88 
 
 		 539 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.41 
 
 		 568 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  40.07 
 
 		 609 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  40.07 
 
 		 609 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  40.22 
 
 		 822 aa  161  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.13 
 
 		 465 aa  158  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  38.27 
 
 		 805 aa  159  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  35.13 
 
 		 459 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  35.13 
 
 		 459 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  35.23 
 
 		 734 aa  157  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.41 
 
 		 421 aa  157  9e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  37.17 
 
 		 700 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  32.23 
 
 		 781 aa  151  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  40.69 
 
 		 655 aa  150  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  36.82 
 
 		 678 aa  150  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  32.32 
 
 		 638 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.93 
 
 		 732 aa  148  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  41.26 
 
 		 810 aa  147  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.11 
 
 		 765 aa  145  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.82 
 
 		 754 aa  140  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  33.1 
 
 		 705 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  32.88 
 
 		 666 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  34.45 
 
 		 587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  35.14 
 
 		 999 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.95 
 
 		 590 aa  128  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  30.9 
 
 		 303 aa  124  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  33.47 
 
 		 498 aa  121  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.09 
 
 		 530 aa  114  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  32.48 
 
 		 450 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  34.65 
 
 		 498 aa  108  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.23 
 
 		 685 aa  107  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  44.44 
 
 		 900 aa  106  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  39.77 
 
 		 687 aa  106  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  34.7 
 
 		 481 aa  105  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  36.36 
 
 		 845 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  34.8 
 
 		 691 aa  105  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  35.09 
 
 		 685 aa  103  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  27.31 
 
 		 352 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.87 
 
 		 795 aa  102  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  40.12 
 
 		 603 aa  101  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.09 
 
 		 723 aa  100  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  42.5 
 
 		 517 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  39.64 
 
 		 662 aa  99.8  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  38.55 
 
 		 862 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  41.88 
 
 		 517 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.98 
 
 		 603 aa  97.8  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.57 
 
 		 398 aa  96.3  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  39.23 
 
 		 722 aa  95.5  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  27.88 
 
 		 513 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  35.82 
 
 		 696 aa  94.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  40.91 
 
 		 834 aa  93.6  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  37.75 
 
 		 605 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  28.26 
 
 		 513 aa  93.6  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  29.15 
 
 		 851 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.69 
 
 		 585 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  32.95 
 
 		 412 aa  90.5  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.17 
 
 		 449 aa  89.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  39.72 
 
 		 598 aa  87.4  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  30.11 
 
 		 571 aa  85.9  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  27.8 
 
 		 653 aa  84.7  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.13 
 
 		 530 aa  73.9  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.23 
 
 		 410 aa  70.1  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.9 
 
 		 748 aa  67.8  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.26 
 
 		 559 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.95 
 
 		 510 aa  66.6  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  22.7 
 
 		 597 aa  63.5  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  26.37 
 
 		 792 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  24.63 
 
 		 844 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  23.9 
 
 		 844 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  29.38 
 
 		 803 aa  59.3  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  22.65 
 
 		 914 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  23.53 
 
 		 847 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  23.53 
 
 		 843 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.37 
 
 		 559 aa  55.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.47 
 
 		 668 aa  55.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.09 
 
 		 606 aa  53.9  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  27.09 
 
 		 371 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1023  ATPase  31.65 
 
 		 599 aa  51.6  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.35 
 
 		 651 aa  51.2  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1956  ATPase  25.51 
 
 		 938 aa  50.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  27.27 
 
 		 578 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3813  AAA ATPase central domain protein  29.18 
 
 		 674 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  26.91 
 
 		 391 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  26.98 
 
 		 523 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2421  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.82 
 
 		 315 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  25.25 
 
 		 679 aa  45.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  44.44 
 
 		 261 aa  44.7  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1328  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  31.58 
 
 		 796 aa  44.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  26.47 
 
 		 475 aa  44.3  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>