107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3352 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
748 aa  1518    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.4 
 
 
530 aa  315  2.9999999999999996e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  41.8 
 
 
803 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.71 
 
 
651 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.38 
 
 
606 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.47 
 
 
819 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.192333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1956  ATPase  29.84 
 
 
938 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  30.95 
 
 
475 aa  93.2  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  31.17 
 
 
474 aa  92.8  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  29.39 
 
 
668 aa  90.9  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  25.36 
 
 
523 aa  85.9  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.603764 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  30.89 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.89 
 
 
465 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.06 
 
 
502 aa  85.1  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  30.89 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1023  ATPase  28.1 
 
 
599 aa  81.6  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.77 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  30.57 
 
 
524 aa  80.9  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.55 
 
 
683 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.41 
 
 
626 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  28.19 
 
 
853 aa  77.8  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.96 
 
 
421 aa  77  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  27.52 
 
 
743 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.44 
 
 
743 aa  75.1  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  29.87 
 
 
899 aa  74.7  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1943  ATPase  26.5 
 
 
403 aa  73.9  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.587571  hitchhiker  0.00000000309284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  27.73 
 
 
700 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  30.98 
 
 
609 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  30.98 
 
 
609 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  26.67 
 
 
589 aa  71.2  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.72 
 
 
698 aa  71.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  30 
 
 
734 aa  70.9  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  24.84 
 
 
805 aa  70.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  27.46 
 
 
539 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  25.9 
 
 
741 aa  67.8  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  25.48 
 
 
810 aa  66.2  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  31.34 
 
 
781 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.96 
 
 
732 aa  65.9  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  27.84 
 
 
629 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.64 
 
 
568 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.22 
 
 
729 aa  62  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  26.81 
 
 
513 aa  62  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  29.74 
 
 
705 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  30.19 
 
 
412 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  28.11 
 
 
655 aa  60.1  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  27.66 
 
 
513 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  25.22 
 
 
822 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.77 
 
 
765 aa  58.5  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.22 
 
 
398 aa  56.6  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.76 
 
 
585 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.44 
 
 
530 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  33.87 
 
 
517 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  31.47 
 
 
678 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  28.14 
 
 
587 aa  55.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  24.73 
 
 
653 aa  54.7  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  31.3 
 
 
517 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  32.06 
 
 
900 aa  54.7  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  24.76 
 
 
914 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.47 
 
 
754 aa  53.9  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.71 
 
 
795 aa  53.9  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  31.93 
 
 
571 aa  53.5  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  26.82 
 
 
498 aa  52.8  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.62 
 
 
590 aa  52.4  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2505  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.56 
 
 
315 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  27.45 
 
 
638 aa  52.4  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  25 
 
 
303 aa  52  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.63 
 
 
325 aa  51.6  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.86 
 
 
324 aa  51.6  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  34.29 
 
 
687 aa  50.8  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  29.86 
 
 
481 aa  50.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.89 
 
 
723 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  34.15 
 
 
851 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  32.09 
 
 
302 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  33.61 
 
 
862 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  34.02 
 
 
605 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  28.75 
 
 
498 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  34.65 
 
 
662 aa  48.5  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  34.02 
 
 
834 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  26.01 
 
 
845 aa  48.5  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.94 
 
 
300 aa  48.9  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  32.09 
 
 
302 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  23.41 
 
 
303 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  26.6 
 
 
352 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2767  ATPase  25.67 
 
 
311 aa  47.8  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.313404  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  32.52 
 
 
598 aa  47.4  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  23.29 
 
 
302 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  38.46 
 
 
999 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  26.54 
 
 
294 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  33 
 
 
603 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  29.7 
 
 
507 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  29.84 
 
 
696 aa  46.6  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  22.11 
 
 
329 aa  46.2  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  29.92 
 
 
698 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  25.73 
 
 
332 aa  45.8  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  40 
 
 
511 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  28.76 
 
 
691 aa  45.8  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2273  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.88 
 
 
323 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  23.16 
 
 
318 aa  45.8  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  22.77 
 
 
340 aa  44.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  46.34 
 
 
508 aa  44.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>