231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3884 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3884  ATPase  100 
 
 		 391 aa  768    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  74.47 
 
 		 385 aa  520  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.32 
 
 		 369 aa  333  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  53.03 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.26 
 
 		 373 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.73 
 
 		 381 aa  318  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  49.21 
 
 		 363 aa  316  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  50.66 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.74 
 
 		 363 aa  305  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.05 
 
 		 365 aa  302  5.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  48.84 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  44.39 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  44.39 
 
 		 362 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  44.9 
 
 		 362 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  44.9 
 
 		 362 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  44.9 
 
 		 362 aa  286  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  44.13 
 
 		 362 aa  285  9e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  44.13 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.64 
 
 		 362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.58 
 
 		 361 aa  281  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  41.84 
 
 		 371 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.5 
 
 		 366 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.33 
 
 		 366 aa  275  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  45.33 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  40.98 
 
 		 372 aa  272  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  45.28 
 
 		 361 aa  269  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.97 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  41.42 
 
 		 370 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  41.14 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.66 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  43.97 
 
 		 355 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.86 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  46.05 
 
 		 364 aa  258  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.5 
 
 		 379 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  42.32 
 
 		 359 aa  252  9.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  41.73 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  46.28 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  43.43 
 
 		 365 aa  245  8e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  41.71 
 
 		 360 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.39 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.86 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.55 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.67 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.09 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  44 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.57 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.64 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  32.08 
 
 		 291 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  31.31 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  35.71 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  28.3 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  28.3 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.95 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  30.04 
 
 		 309 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.99 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.96 
 
 		 300 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  30.94 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  31.86 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  31.13 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.94 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.31 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  24.89 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.18 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.63 
 
 		 298 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  29.72 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.63 
 
 		 298 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.92 
 
 		 729 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  32.68 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.24 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  27.96 
 
 		 810 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  29.96 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  27.72 
 
 		 734 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.5 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  28.99 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  26.9 
 
 		 853 aa  56.6  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2157  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.37 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  29.61 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  28.14 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  27.72 
 
 		 655 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  30.18 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.11 
 
 		 278 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.76 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.61 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  29.91 
 
 		 303 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  31.68 
 
 		 620 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  28.63 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  30.57 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  28.57 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.64 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.2 
 
 		 297 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  28.44 
 
 		 312 aa  53.9  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.43 
 
 		 295 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.61 
 
 		 302 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  28.1 
 
 		 297 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  28.57 
 
 		 298 aa  53.5  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  31.22 
 
 		 303 aa  53.1  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  30 
 
 		 300 aa  53.1  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  29.35 
 
 		 296 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  32.31 
 
 		 302 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>