137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1963 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  100 
 
 
300 aa  610  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  52.23 
 
 
378 aa  306  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  51.51 
 
 
363 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.35 
 
 
381 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.17 
 
 
363 aa  296  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  50.5 
 
 
376 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  51.51 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  49.32 
 
 
362 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  49.32 
 
 
362 aa  273  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  49.32 
 
 
362 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  49.32 
 
 
362 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  48.99 
 
 
362 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.32 
 
 
362 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  48.99 
 
 
362 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  48.99 
 
 
362 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.15 
 
 
373 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.76 
 
 
369 aa  265  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.24 
 
 
365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.39 
 
 
385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  44 
 
 
391 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.08 
 
 
358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.79 
 
 
361 aa  211  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  37.59 
 
 
372 aa  208  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  41.24 
 
 
361 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.55 
 
 
379 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  38.72 
 
 
364 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  39.59 
 
 
355 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  41.13 
 
 
364 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  36.73 
 
 
371 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.21 
 
 
366 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  41.22 
 
 
395 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  38.23 
 
 
370 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  38.1 
 
 
370 aa  202  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  40.21 
 
 
366 aa  202  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.21 
 
 
366 aa  202  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  40.55 
 
 
359 aa  198  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.14 
 
 
378 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  40.49 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.35 
 
 
362 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  40.28 
 
 
365 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.58 
 
 
380 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.95 
 
 
363 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.3 
 
 
364 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.79 
 
 
366 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.23 
 
 
371 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.6 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.76 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  30.33 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.49 
 
 
324 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  33.33 
 
 
620 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.95 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  30.94 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.34 
 
 
305 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  28.02 
 
 
309 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  29.3 
 
 
302 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  28.82 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  28.32 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.11 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  28.9 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  31.21 
 
 
304 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  31.21 
 
 
304 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.75 
 
 
302 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  31.21 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  29.38 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  31.21 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.57 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  26.82 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.75 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  33.14 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  28.8 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  28.25 
 
 
305 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0683  ATPase  28.57 
 
 
325 aa  47  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.128689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  29.01 
 
 
334 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  28.12 
 
 
400 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  29.3 
 
 
339 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.8 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  27.33 
 
 
302 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.43 
 
 
299 aa  46.2  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  29.48 
 
 
304 aa  46.2  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25 
 
 
290 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  23.08 
 
 
320 aa  45.8  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  25.77 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.83 
 
 
298 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.83 
 
 
298 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  29.48 
 
 
301 aa  45.8  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  29.21 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  26.55 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.85 
 
 
304 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  29.17 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  28.19 
 
 
332 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.27 
 
 
378 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  27.31 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  25.52 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  25.52 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.16 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  29.05 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.42 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.48 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  30.68 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  26.99 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>