290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2251 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2251  ATPase  100 
 
 
312 aa  610  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  81 
 
 
305 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  74.92 
 
 
328 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  72.41 
 
 
328 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  57 
 
 
300 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  53.67 
 
 
302 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  53.9 
 
 
314 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.33 
 
 
300 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  52.67 
 
 
303 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55 
 
 
300 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  53 
 
 
302 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  52.67 
 
 
302 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  52.48 
 
 
301 aa  309  4e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  51.67 
 
 
302 aa  308  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  53.61 
 
 
309 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  54.15 
 
 
304 aa  308  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  54.28 
 
 
296 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  52.51 
 
 
304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  51.67 
 
 
309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  53 
 
 
314 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50 
 
 
300 aa  298  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  51.16 
 
 
296 aa  298  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.9 
 
 
305 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  51.83 
 
 
303 aa  296  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  54.1 
 
 
298 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  53.44 
 
 
305 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.13 
 
 
298 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.13 
 
 
298 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  50 
 
 
303 aa  295  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.62 
 
 
295 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  52.16 
 
 
304 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.01 
 
 
302 aa  294  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  53.29 
 
 
295 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  52.16 
 
 
304 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  51.78 
 
 
301 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  54.45 
 
 
294 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.35 
 
 
314 aa  287  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  50.17 
 
 
296 aa  287  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.83 
 
 
299 aa  286  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  50.66 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  50.35 
 
 
291 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  51.16 
 
 
314 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  53.85 
 
 
293 aa  276  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.93 
 
 
304 aa  276  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.49 
 
 
297 aa  276  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  54.05 
 
 
318 aa  275  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  52.92 
 
 
324 aa  272  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  53.42 
 
 
299 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.97 
 
 
298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.67 
 
 
319 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  51.92 
 
 
316 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.31 
 
 
294 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  53.28 
 
 
292 aa  269  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.05 
 
 
305 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  52.43 
 
 
288 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.98 
 
 
308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  45.57 
 
 
315 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2036  ATPase  50.34 
 
 
307 aa  262  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0580414  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.51 
 
 
296 aa  261  8.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  45.89 
 
 
300 aa  260  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  48.51 
 
 
293 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  43.93 
 
 
315 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  51.31 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  47.06 
 
 
306 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.75 
 
 
298 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  46.86 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  47.02 
 
 
284 aa  252  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  51.6 
 
 
288 aa  251  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  45.64 
 
 
297 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.27 
 
 
413 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  51.8 
 
 
280 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  46.6 
 
 
297 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  41.64 
 
 
315 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  48.62 
 
 
291 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.08 
 
 
306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  41.67 
 
 
315 aa  245  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.26 
 
 
306 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  43.58 
 
 
303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.26 
 
 
322 aa  242  5e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.41 
 
 
302 aa  242  7e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  44.37 
 
 
310 aa  238  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0102  ATPase  42.95 
 
 
311 aa  238  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.21 
 
 
291 aa  235  6e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  40.97 
 
 
316 aa  235  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.94 
 
 
323 aa  235  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  48.72 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5478  ATPase  47.77 
 
 
377 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234012  normal  0.317231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  43.99 
 
 
326 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  43.64 
 
 
326 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40 
 
 
321 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  43.21 
 
 
294 aa  228  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  43.84 
 
 
297 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  42.12 
 
 
319 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2759  AAA ATPase central domain protein  43.51 
 
 
292 aa  225  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0232984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.71 
 
 
294 aa  225  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.55 
 
 
295 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.06 
 
 
307 aa  222  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  42.16 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1932  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.1 
 
 
421 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  44.18 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.290387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>