More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3676 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3676  ATPase  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  94.7 
 
 		 302 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  93.33 
 
 		 300 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  89 
 
 		 302 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  85.43 
 
 		 302 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  85.19 
 
 		 303 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  81.02 
 
 		 314 aa  497  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  73.2 
 
 		 300 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  72.26 
 
 		 300 aa  441  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  70.17 
 
 		 309 aa  424  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  70.1 
 
 		 303 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  68.68 
 
 		 301 aa  411  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  64.8 
 
 		 309 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  67.47 
 
 		 304 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  65.76 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  66.1 
 
 		 304 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  66.1 
 
 		 304 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  64.63 
 
 		 314 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  63.48 
 
 		 303 aa  388  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  62.01 
 
 		 299 aa  376  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  62.42 
 
 		 305 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  61.3 
 
 		 302 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  61.72 
 
 		 296 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  60.55 
 
 		 296 aa  364  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.28 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  58.67 
 
 		 300 aa  358  4e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  58.81 
 
 		 324 aa  350  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  57.91 
 
 		 296 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.51 
 
 		 300 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.34 
 
 		 298 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.34 
 
 		 298 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  56.42 
 
 		 301 aa  338  9e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.51 
 
 		 295 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  56.51 
 
 		 295 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  57 
 
 		 305 aa  331  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  55.74 
 
 		 298 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  57.09 
 
 		 314 aa  322  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  54.21 
 
 		 305 aa  322  6e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  53.67 
 
 		 312 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.77 
 
 		 297 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.57 
 
 		 328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.55 
 
 		 304 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  48.6 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  53.79 
 
 		 291 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  51.74 
 
 		 316 aa  297  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  55.35 
 
 		 297 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  56.88 
 
 		 318 aa  296  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.63 
 
 		 294 aa  296  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  55.02 
 
 		 297 aa  292  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.91 
 
 		 298 aa  290  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  50.85 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  54.38 
 
 		 288 aa  288  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  55.47 
 
 		 291 aa  287  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.86 
 
 		 305 aa  285  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  54.48 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  55.15 
 
 		 299 aa  285  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  53.21 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.33 
 
 		 308 aa  281  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  53.65 
 
 		 280 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2036  ATPase  50 
 
 		 307 aa  278  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0580414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  51.69 
 
 		 292 aa  278  9e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.59 
 
 		 323 aa  277  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.7 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  49.12 
 
 		 310 aa  272  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  50.7 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  50.35 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.92 
 
 		 298 aa  270  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.17 
 
 		 296 aa  269  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  47.67 
 
 		 315 aa  268  5.9999999999999995e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.18 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  47.79 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.64 
 
 		 319 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  47.97 
 
 		 315 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  48.06 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  49.28 
 
 		 300 aa  262  4.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  49.81 
 
 		 293 aa  262  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  51.13 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  47.47 
 
 		 315 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  50.54 
 
 		 302 aa  258  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.92 
 
 		 306 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  47.75 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.96 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.42 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.11 
 
 		 306 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  46.15 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.48 
 
 		 291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  48.76 
 
 		 319 aa  252  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  44 
 
 		 316 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  46.1 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  46.1 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  46.1 
 
 		 295 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2179  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.35 
 
 		 291 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000102447  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.01 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  46.15 
 
 		 294 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.89 
 
 		 413 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  46.32 
 
 		 291 aa  249  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  47.04 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  44.93 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.446115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  48.18 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.65 
 
 		 302 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>