263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1596 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 328 aa  647    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  82.52 
 
 		 328 aa  522  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  75.24 
 
 		 305 aa  468  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  72.41 
 
 		 312 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  53.27 
 
 		 301 aa  320  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  52.35 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  53 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  52.75 
 
 		 309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.17 
 
 		 300 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  51.26 
 
 		 303 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  52.52 
 
 		 314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  51.57 
 
 		 302 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  52.52 
 
 		 304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.31 
 
 		 300 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  49.85 
 
 		 303 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  50 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  50.94 
 
 		 302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  50.94 
 
 		 302 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  51.26 
 
 		 304 aa  301  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  52.61 
 
 		 304 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  49.06 
 
 		 302 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  51.56 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.75 
 
 		 305 aa  298  7e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  49.53 
 
 		 303 aa  296  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.44 
 
 		 302 aa  295  8e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  51.14 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.73 
 
 		 300 aa  293  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  48.58 
 
 		 309 aa  292  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.31 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.31 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  50.16 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  49.7 
 
 		 301 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  49.35 
 
 		 296 aa  288  9e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.81 
 
 		 295 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  50.78 
 
 		 305 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  51.46 
 
 		 295 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.4 
 
 		 314 aa  285  7e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  49.7 
 
 		 298 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.12 
 
 		 299 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.8 
 
 		 294 aa  278  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.82 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  49.67 
 
 		 294 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  51.5 
 
 		 314 aa  275  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  54.22 
 
 		 324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  48.55 
 
 		 291 aa  271  9e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  50.47 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.25 
 
 		 297 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.65 
 
 		 319 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.81 
 
 		 298 aa  266  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.49 
 
 		 308 aa  265  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  49.83 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2036  ATPase  46.62 
 
 		 307 aa  259  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0580414  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  46.56 
 
 		 334 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  48.5 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  48.69 
 
 		 293 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  48.01 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0102  ATPase  45.42 
 
 		 311 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  45.89 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  45.91 
 
 		 306 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.34 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  43.17 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  46.84 
 
 		 288 aa  252  6e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.19 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  43.35 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  47.9 
 
 		 280 aa  249  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.97 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.13 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  40.84 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  43.69 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  43.04 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  43.04 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  44.08 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  43.67 
 
 		 310 aa  245  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  44.65 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  44.37 
 
 		 298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  48 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  41.74 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  42.35 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48 
 
 		 296 aa  242  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.66 
 
 		 413 aa  242  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.95 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  41.74 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.39 
 
 		 322 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.2 
 
 		 321 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  44.16 
 
 		 293 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  43.97 
 
 		 326 aa  232  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.72 
 
 		 291 aa  232  8.000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  42.95 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.13 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  43.32 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  43.77 
 
 		 302 aa  228  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5478  ATPase  46.1 
 
 		 377 aa  225  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234012  normal  0.317231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.25 
 
 		 294 aa  225  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  42 
 
 		 319 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  39.17 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2179  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.59 
 
 		 291 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000102447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.64 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.51 
 
 		 307 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.21 
 
 		 302 aa  222  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0558  AAA ATPase  41.92 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.847744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>