More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0102 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0102  ATPase  100 
 
 
311 aa  630  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  67.45 
 
 
315 aa  425  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  58.25 
 
 
315 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  58.72 
 
 
315 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  58.7 
 
 
319 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  58.86 
 
 
315 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  57.61 
 
 
306 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.45 
 
 
323 aa  318  5e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  56.54 
 
 
326 aa  318  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  56.18 
 
 
326 aa  318  7.999999999999999e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  54.58 
 
 
334 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.16 
 
 
306 aa  315  7e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.2 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  50.17 
 
 
303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  53.36 
 
 
310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  50.9 
 
 
316 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.72 
 
 
413 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5478  ATPase  49.34 
 
 
377 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234012  normal  0.317231 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  49.34 
 
 
300 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.12 
 
 
321 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1932  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.35 
 
 
421 aa  275  9e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  47.77 
 
 
299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.18 
 
 
305 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.7 
 
 
300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  47.85 
 
 
301 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.06 
 
 
294 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  49.65 
 
 
295 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.33 
 
 
298 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.33 
 
 
298 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.44 
 
 
314 aa  265  8.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50 
 
 
295 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.64 
 
 
319 aa  262  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  48.28 
 
 
284 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.94 
 
 
299 aa  260  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2179  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.13 
 
 
291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000102447  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  47.69 
 
 
294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2759  AAA ATPase central domain protein  47.93 
 
 
292 aa  259  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0232984  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  47.25 
 
 
299 aa  258  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7758  ATPase  50.52 
 
 
283 aa  258  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  48.62 
 
 
296 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  48.4 
 
 
297 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  48.4 
 
 
302 aa  257  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  47.69 
 
 
291 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  46.18 
 
 
304 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  48.98 
 
 
296 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.3 
 
 
295 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.42 
 
 
328 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  46.18 
 
 
294 aa  255  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  48.75 
 
 
295 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  48.75 
 
 
295 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  46.67 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0783  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.42 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  48.75 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.48 
 
 
307 aa  253  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  46.62 
 
 
291 aa  252  7e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.446115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.5 
 
 
300 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  43.05 
 
 
293 aa  251  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  44.71 
 
 
291 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.58 
 
 
298 aa  251  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  44.95 
 
 
291 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.93 
 
 
299 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  47.89 
 
 
309 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  48.2 
 
 
300 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  45.61 
 
 
303 aa  249  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  45.42 
 
 
305 aa  248  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.15 
 
 
302 aa  248  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  45.36 
 
 
304 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  43.26 
 
 
328 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  45.45 
 
 
309 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.76 
 
 
322 aa  246  3e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  45.36 
 
 
304 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  46.74 
 
 
303 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  46.07 
 
 
304 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  47.31 
 
 
303 aa  245  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.38 
 
 
300 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  48.19 
 
 
302 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  47.83 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.07 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0558  AAA ATPase  47.42 
 
 
333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.847744  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  47.83 
 
 
302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  44.97 
 
 
314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  51.71 
 
 
324 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  46.37 
 
 
314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  46.18 
 
 
318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  44.97 
 
 
305 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  45.92 
 
 
298 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  46.34 
 
 
296 aa  242  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.21 
 
 
302 aa  241  9e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  44.93 
 
 
288 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  43.6 
 
 
300 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  47.1 
 
 
302 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  47.26 
 
 
293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.1 
 
 
304 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  44.98 
 
 
302 aa  238  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  42.95 
 
 
312 aa  238  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.21 
 
 
294 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.88 
 
 
291 aa  236  3e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  43.62 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.61 
 
 
302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  43.61 
 
 
292 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>