More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0582 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  100 
 
 
304 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  97.7 
 
 
304 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  94.74 
 
 
304 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  80.74 
 
 
301 aa  488  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  78.86 
 
 
304 aa  474  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  79.46 
 
 
303 aa  473  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  72.54 
 
 
300 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  72.7 
 
 
300 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  65.42 
 
 
300 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  66.1 
 
 
302 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  66.78 
 
 
302 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  64.67 
 
 
309 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  65.31 
 
 
302 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  64.97 
 
 
302 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  65.08 
 
 
303 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  66.1 
 
 
303 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  64.77 
 
 
309 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  66 
 
 
314 aa  391  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  64.31 
 
 
314 aa  387  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  63.88 
 
 
300 aa  362  6e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.8 
 
 
314 aa  359  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.94 
 
 
305 aa  359  3e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.45 
 
 
302 aa  358  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  59.11 
 
 
296 aa  358  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.64 
 
 
299 aa  358  8e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  61.94 
 
 
324 aa  349  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  57.73 
 
 
296 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  57.88 
 
 
296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.54 
 
 
300 aa  329  4e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.51 
 
 
295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  56.45 
 
 
295 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.24 
 
 
298 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.24 
 
 
298 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  56.66 
 
 
301 aa  323  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  55.59 
 
 
314 aa  322  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  56.85 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  56.46 
 
 
298 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  54.96 
 
 
305 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  58.36 
 
 
291 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  51.74 
 
 
328 aa  305  8.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  58.63 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.26 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  52.16 
 
 
312 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.48 
 
 
304 aa  299  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.82 
 
 
294 aa  296  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.83 
 
 
297 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  54.04 
 
 
316 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  51.92 
 
 
294 aa  289  4e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  56.88 
 
 
293 aa  288  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.32 
 
 
305 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  54.86 
 
 
299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  55.43 
 
 
288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  54.21 
 
 
297 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  53.21 
 
 
291 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  53.87 
 
 
297 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.52 
 
 
298 aa  275  6e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.57 
 
 
319 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.93 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  51.5 
 
 
293 aa  272  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.41 
 
 
302 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  52.38 
 
 
280 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  52.06 
 
 
292 aa  269  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  54.42 
 
 
288 aa  268  8.999999999999999e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  48.64 
 
 
315 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.56 
 
 
296 aa  266  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  48.82 
 
 
315 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  49.09 
 
 
300 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.32 
 
 
323 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.75 
 
 
295 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  49.12 
 
 
295 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  46.67 
 
 
310 aa  257  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  49.12 
 
 
295 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  50.35 
 
 
294 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  48.76 
 
 
295 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  50.7 
 
 
291 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  46.8 
 
 
315 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2036  ATPase  45.64 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  46.46 
 
 
315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  48.4 
 
 
319 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.09 
 
 
298 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  49.45 
 
 
291 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.446115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  49.82 
 
 
298 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  50.57 
 
 
297 aa  250  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  47.54 
 
 
326 aa  249  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  47.6 
 
 
299 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  47.54 
 
 
326 aa  249  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0102  ATPase  46.07 
 
 
311 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.92 
 
 
307 aa  246  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  42.96 
 
 
316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  46.04 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  48.53 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  46.53 
 
 
306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.02 
 
 
302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.18 
 
 
322 aa  242  7e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.71 
 
 
291 aa  240  2e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2179  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.82 
 
 
291 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000102447  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.37 
 
 
299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  46.29 
 
 
334 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.7 
 
 
306 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.36 
 
 
306 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>