More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1485 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1485  ATPase  100 
 
 		 309 aa  618  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  73.75 
 
 		 309 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  72.45 
 
 		 300 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.19 
 
 		 300 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  70.17 
 
 		 302 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  70.07 
 
 		 303 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.85 
 
 		 300 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  69.93 
 
 		 302 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  69.15 
 
 		 302 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  66.78 
 
 		 303 aa  414  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  67.57 
 
 		 302 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  67.91 
 
 		 314 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  66.1 
 
 		 304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  67.81 
 
 		 314 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  67.34 
 
 		 304 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  64.97 
 
 		 303 aa  394  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  63.95 
 
 		 301 aa  394  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  65.44 
 
 		 304 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  64.77 
 
 		 304 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  63.21 
 
 		 305 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  62.76 
 
 		 296 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.71 
 
 		 314 aa  363  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  61.81 
 
 		 324 aa  362  6e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  61.92 
 
 		 300 aa  360  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.93 
 
 		 299 aa  361  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.28 
 
 		 302 aa  360  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  62.28 
 
 		 296 aa  359  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  59.32 
 
 		 300 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  57.99 
 
 		 314 aa  340  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.8 
 
 		 295 aa  338  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  56.46 
 
 		 295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  57.49 
 
 		 296 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  56.66 
 
 		 301 aa  330  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  56.12 
 
 		 298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.36 
 
 		 298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.36 
 
 		 298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  52.94 
 
 		 305 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.32 
 
 		 304 aa  316  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  56.93 
 
 		 318 aa  308  8e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  53.24 
 
 		 316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  54.51 
 
 		 291 aa  305  7e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.63 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  53.36 
 
 		 305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  51.67 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.94 
 
 		 298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.38 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.96 
 
 		 305 aa  296  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  54.09 
 
 		 288 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2036  ATPase  50.18 
 
 		 307 aa  295  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0580414  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  53.93 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  55.97 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  52.63 
 
 		 294 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.58 
 
 		 328 aa  292  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  49.84 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  53.02 
 
 		 292 aa  288  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  55.07 
 
 		 293 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.92 
 
 		 323 aa  286  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.06 
 
 		 296 aa  285  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  51.37 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  52.92 
 
 		 280 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  50.68 
 
 		 326 aa  275  8e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.02 
 
 		 298 aa  275  9e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  53.45 
 
 		 299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.53 
 
 		 294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  52.19 
 
 		 288 aa  272  6e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  50.71 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  52.09 
 
 		 300 aa  269  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  53.45 
 
 		 291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.5 
 
 		 319 aa  267  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  48.75 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.43 
 
 		 291 aa  266  5e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.97 
 
 		 302 aa  265  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  49.13 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  48.75 
 
 		 293 aa  262  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  47.6 
 
 		 315 aa  262  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.94 
 
 		 322 aa  258  6e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  48.25 
 
 		 334 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.62 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.1 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.99 
 
 		 321 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.75 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.75 
 
 		 295 aa  255  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  47.16 
 
 		 284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  48.44 
 
 		 297 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  47.26 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  44.76 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0102  ATPase  47.89 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.29 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  48.6 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.33 
 
 		 299 aa  245  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  45.27 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  45.83 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  46.95 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  46.95 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  46.95 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  48.89 
 
 		 299 aa  242  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  46.59 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2759  AAA ATPase central domain protein  44.28 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0232984  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  46.07 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  46.59 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>