More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5445 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5445  ATPase  100 
 
 
300 aa  584  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  93.33 
 
 
300 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  73.29 
 
 
300 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  73.56 
 
 
302 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  72.26 
 
 
302 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  72.45 
 
 
302 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  72.45 
 
 
309 aa  437  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  72.85 
 
 
302 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  72.51 
 
 
303 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  72.45 
 
 
309 aa  440  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  73.29 
 
 
304 aa  433  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  74.06 
 
 
304 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  72.51 
 
 
314 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  72.7 
 
 
304 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  69.67 
 
 
303 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  72.7 
 
 
304 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  69.49 
 
 
301 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  68.24 
 
 
314 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  68.49 
 
 
303 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  68.58 
 
 
305 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  65.7 
 
 
314 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  65.05 
 
 
324 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  62.2 
 
 
296 aa  368  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  61.73 
 
 
299 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  61.17 
 
 
302 aa  362  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  61.51 
 
 
296 aa  355  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  63.18 
 
 
300 aa  354  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  61.3 
 
 
296 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.14 
 
 
300 aa  342  5e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.42 
 
 
295 aa  334  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  60.76 
 
 
295 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  62.06 
 
 
314 aa  331  9e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  58.25 
 
 
305 aa  329  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  59.12 
 
 
301 aa  328  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.36 
 
 
298 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.36 
 
 
298 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.07 
 
 
297 aa  322  5e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  53.73 
 
 
328 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  57 
 
 
312 aa  320  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  59.03 
 
 
318 aa  318  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  59.79 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.72 
 
 
304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  57.8 
 
 
305 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  55.79 
 
 
291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  59.57 
 
 
293 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  55.75 
 
 
294 aa  300  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.93 
 
 
294 aa  299  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.87 
 
 
298 aa  297  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  55.44 
 
 
316 aa  296  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  56.04 
 
 
297 aa  295  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.78 
 
 
305 aa  294  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  60 
 
 
299 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  58.58 
 
 
288 aa  292  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  56.41 
 
 
297 aa  291  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.85 
 
 
308 aa  291  8e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.08 
 
 
319 aa  285  5e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2036  ATPase  54.75 
 
 
307 aa  279  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.7 
 
 
323 aa  278  9e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  55.63 
 
 
293 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  52.48 
 
 
300 aa  275  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  52.94 
 
 
306 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  55.56 
 
 
291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  53.61 
 
 
292 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  51.74 
 
 
334 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  50.68 
 
 
310 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.25 
 
 
306 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.63 
 
 
298 aa  269  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.58 
 
 
296 aa  268  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.9 
 
 
306 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  53.7 
 
 
280 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  49.83 
 
 
315 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  56.44 
 
 
288 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.76 
 
 
295 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  52.31 
 
 
326 aa  265  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  50.83 
 
 
326 aa  265  8e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  49.48 
 
 
315 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  52.86 
 
 
298 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  47.08 
 
 
315 aa  263  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  49.83 
 
 
315 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.05 
 
 
322 aa  260  2e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.73 
 
 
302 aa  259  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  51.67 
 
 
297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  50.71 
 
 
319 aa  258  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.88 
 
 
291 aa  258  1e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  53.36 
 
 
299 aa  255  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  50.72 
 
 
302 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  45.74 
 
 
316 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.82 
 
 
307 aa  252  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  49.09 
 
 
295 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.52 
 
 
302 aa  251  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  49.09 
 
 
295 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  48.73 
 
 
295 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  50.18 
 
 
294 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0102  ATPase  48.2 
 
 
311 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  48.39 
 
 
284 aa  248  6e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  46.85 
 
 
303 aa  248  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.12 
 
 
299 aa  247  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.77 
 
 
321 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.62 
 
 
413 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>