More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0632 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0632  ATPase  100 
 
 
280 aa  559  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  69.4 
 
 
294 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  63.7 
 
 
316 aa  349  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  59.64 
 
 
292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  62.91 
 
 
304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  63.5 
 
 
296 aa  323  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  61.48 
 
 
305 aa  316  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  62.55 
 
 
318 aa  304  9.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.58 
 
 
305 aa  299  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  54.04 
 
 
301 aa  299  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  55.09 
 
 
314 aa  296  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  53.48 
 
 
302 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.74 
 
 
300 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  53.65 
 
 
302 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  58.15 
 
 
288 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  53.31 
 
 
304 aa  289  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  52.92 
 
 
302 aa  288  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  55.47 
 
 
314 aa  287  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.44 
 
 
314 aa  287  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  54.21 
 
 
304 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  52.55 
 
 
303 aa  286  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  52.92 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.38 
 
 
302 aa  285  8e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.8 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.8 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  51.65 
 
 
303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  52.55 
 
 
302 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  53.73 
 
 
304 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  55.2 
 
 
301 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  52.99 
 
 
304 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  52.75 
 
 
314 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.66 
 
 
299 aa  280  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.96 
 
 
300 aa  278  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  50.55 
 
 
309 aa  278  9e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.35 
 
 
295 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  54.35 
 
 
296 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  54.29 
 
 
295 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  53.7 
 
 
300 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  54.78 
 
 
291 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  51.94 
 
 
303 aa  275  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  53.26 
 
 
296 aa  275  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  56.06 
 
 
305 aa  271  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.56 
 
 
294 aa  271  9e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  51.81 
 
 
305 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  53.79 
 
 
298 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.48 
 
 
308 aa  270  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.52 
 
 
300 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  52.87 
 
 
296 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.4 
 
 
322 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  51.8 
 
 
312 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  46.86 
 
 
328 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.9 
 
 
328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  51.1 
 
 
300 aa  256  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50 
 
 
297 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  52.73 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.05 
 
 
319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  45.26 
 
 
316 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  50.55 
 
 
293 aa  251  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  52.08 
 
 
324 aa  248  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  52.19 
 
 
299 aa  248  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  46.79 
 
 
298 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.87 
 
 
298 aa  244  9e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.82 
 
 
298 aa  242  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  48.87 
 
 
284 aa  242  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.26 
 
 
323 aa  240  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  48.43 
 
 
326 aa  238  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  49.09 
 
 
291 aa  238  8e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  47.27 
 
 
297 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2036  ATPase  47.25 
 
 
307 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0580414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  47.74 
 
 
326 aa  236  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  45.36 
 
 
315 aa  236  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  48.75 
 
 
306 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  48.73 
 
 
293 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.81 
 
 
302 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.75 
 
 
306 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  45.36 
 
 
310 aa  235  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.19 
 
 
291 aa  235  6e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.6 
 
 
295 aa  235  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.39 
 
 
306 aa  234  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  46.91 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  47.1 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0102  ATPase  44.6 
 
 
311 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  44.56 
 
 
303 aa  229  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.45 
 
 
321 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.95 
 
 
299 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  44.16 
 
 
300 aa  225  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  46.1 
 
 
334 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  45.88 
 
 
302 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2179  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48 
 
 
291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000102447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.57 
 
 
294 aa  221  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.64 
 
 
413 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  44.48 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  46.69 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  46.49 
 
 
291 aa  219  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.446115 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.65 
 
 
302 aa  219  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5478  ATPase  46.95 
 
 
377 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234012  normal  0.317231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.01 
 
 
307 aa  217  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2759  AAA ATPase central domain protein  43.61 
 
 
292 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0232984  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0783  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.45 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  46.99 
 
 
291 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>