More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1770 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  100 
 
 		 304 aa  614  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  76.92 
 
 		 301 aa  480  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  78.52 
 
 		 304 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  78.86 
 
 		 304 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  78.19 
 
 		 304 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  77.03 
 
 		 303 aa  461  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  73.63 
 
 		 300 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  73.29 
 
 		 300 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  65.89 
 
 		 303 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  65.76 
 
 		 302 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  65.07 
 
 		 302 aa  407  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  66.22 
 
 		 302 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.1 
 
 		 300 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  66.1 
 
 		 309 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  66.78 
 
 		 302 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  65.08 
 
 		 309 aa  401  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  66.21 
 
 		 314 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  65.29 
 
 		 303 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  65.86 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  62.58 
 
 		 305 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.26 
 
 		 302 aa  368  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  59.79 
 
 		 296 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  63.31 
 
 		 324 aa  364  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  58.22 
 
 		 296 aa  353  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.12 
 
 		 299 aa  352  2.9999999999999997e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.36 
 
 		 314 aa  350  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  62.68 
 
 		 300 aa  346  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  56.55 
 
 		 296 aa  338  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.55 
 
 		 300 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  56.36 
 
 		 295 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.01 
 
 		 295 aa  332  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  57 
 
 		 301 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.24 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.24 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  55.33 
 
 		 314 aa  326  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  57.24 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  56.55 
 
 		 298 aa  318  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  55.67 
 
 		 305 aa  316  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.35 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.71 
 
 		 304 aa  309  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.42 
 
 		 297 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.58 
 
 		 305 aa  305  9.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  52.51 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  56.41 
 
 		 291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  50.78 
 
 		 328 aa  301  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  55.83 
 
 		 318 aa  301  9e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  57.62 
 
 		 293 aa  296  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  52.51 
 
 		 297 aa  295  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  54.45 
 
 		 299 aa  295  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  52.17 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  55.64 
 
 		 288 aa  291  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.27 
 
 		 294 aa  290  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  52.67 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.65 
 
 		 298 aa  285  7e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.32 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  52.46 
 
 		 291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  51.59 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.17 
 
 		 302 aa  280  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  53.31 
 
 		 280 aa  278  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.84 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  50 
 
 		 306 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.5 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  50.68 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  52.45 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  48.87 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  49.11 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  46.49 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2036  ATPase  48.18 
 
 		 307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0580414  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  50.76 
 
 		 300 aa  269  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.93 
 
 		 295 aa  267  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.45 
 
 		 306 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  53.7 
 
 		 288 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.11 
 
 		 306 aa  265  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  47.96 
 
 		 310 aa  265  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.83 
 
 		 307 aa  265  5.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  48.06 
 
 		 284 aa  265  8e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  49.12 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  50.18 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  49.13 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  49.12 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  50.74 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  49.12 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.9 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  49.82 
 
 		 294 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  47.6 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  47.96 
 
 		 302 aa  262  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.18 
 
 		 296 aa  262  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  48.94 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  47.42 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  49.11 
 
 		 297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.77 
 
 		 299 aa  258  9e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  48.76 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.446115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0102  ATPase  46.18 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  47.74 
 
 		 319 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.91 
 
 		 302 aa  256  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  46.74 
 
 		 315 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.73 
 
 		 291 aa  255  8e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.11 
 
 		 321 aa  251  7e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2179  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000102447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  43.4 
 
 		 316 aa  248  9e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>